PCDH11X

PCDH11X
Ідентифікатори
Символи	PCDH11X, PCDH-X, PCDH11, PCDHX, PPP1R119, protocadherin 11 X-linked, PCDH22, PCDH11Y, PCDH-Y
Зовнішні ІД	OMIM: 300246 MGI: 2442849 HomoloGene: 13194 GeneCards: PCDH11X
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана Біологічний процес • negative regulation of phosphatase activity • адгезія клітин • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27328	245578
Ensembl	ENSG00000102290	ENSMUSG00000034755
UniProt	Q9BZA7	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001168360 NM_001168361 NM_001168362 NM_001168363 NM_014522 NM_032967 NM_032968 NM_032969	NM_001081385 NM_001271809 NM_001271810
RefSeq (білок)	NP_001161832 NP_001161833 NP_001161834 NP_001161835 NP_116750 NP_116751	н/д
Локус (UCSC)	Хр. X: 91.78 – 92.62 Mb	Хр. X: 119.2 – 119.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDH11X (англ. Protocadherin 11 X-linked) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі Y-хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 347 амінокислот, а молекулярна маса — 147 558.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDLLSGTYIF		AVLLACVVFH		SGAQEKNYTI		REEMPENVLI		GDLLKDLNLS
LIPNKSLTTA		MQFKLVYKTG		DVPLIRIEED		TGEIFTTGAR		IDREKLCAGI
PRDEHCFYEV		EVAILPDEIF		RLVKIRFLIE		DINDNAPLFP		ATVINISIPE
NSAINSKYTL		PAAVDPDVGI		NGVQNYELIK		SQNIFGLDVI		ETPEGDKMPQ
LIVQKELDRE		EKDTYVMKVK		VEDGGFPQRS		STAILQVSVT		DTNDNHPVFK
ETEIEVSIPE		NAPVGTSVTQ		LHATDADIGE		NAKIHFSFSN		LVSNIARRLF
HLNATTGLIT		IKEPLDREET		PNHKLLVLAS		DGGLMPARAM		VLVNVTDVND
NVPSIDIRYI		VNPVNDTVVL		SENIPLNTKI		ALITVTDKDA		DHNGRVTCFT
DHEIPFRLRP		VFSNQFLLET		AAYLDYESTK		EYAIKLLAAD		AGKPPLNQSA
MLFIKVKDEN		DNAPVFTQSF		VTVSIPENNS		PGIQLTKVSA		MDADSGPNAK
INYLLGPDAP		PEFSLDCRTG		MLTVVKKLDR		EKEDKYLFTI		LAKDNGVPPL
TSNVTVFVSI		IDQNDNSPVF		THNEYNFYVP		ENLPRHGTVG		LITVTDPDYG
DNSAVTLSIL		DENDDFTIDS		QTGVIRPNIS		FDREKQESYT		FYVKAEDGGR
VSRSSSAKVT		INVVDVNDNK		PVFIVPPSNC		SYELVLPSTN		PGTVVFQVIA
VDNDTGMNAE		VRYSIVGGNT		RDLFAIDQET		GNITLMEKCD		VTDLGLHRVL
VKANDLGQPD		SLFSVVIVNL		FVNESVTNAT		LINELVRKST		EAPVTPNTEI
ADVSSPTSDY		VKILVAAVAG		TITVVVVIFI		TAVVRCRQAP		HLKAAQKNKQ
NSEWATPNPE		NRQMIMMKKK		KKKKKHSPKN		LLLNFVTIEE		TKADDVDSDG
NRVTLDLPID		LEEQTMGKYN		WVTTPTTFKP		DSPDLARHYK		SASPQPAFQI
QPETPLNSKH		HIIQELPLDN		TFVACDSISK		CSSSSSDPYS		VSDCGYPVTT
FEVPVSVHTR		PPMKEVVRSC		TPMKESTTME		IWIHPQPQRK		SEGKVAGKSQ
RRVTFHLPEG		SQESSSDGGL		GDHDAGSLTS		TSHGLPLGYP		QEEYFDRATP
SNRTEGDGNS		DPESTFIPGL		KKAAEITVQP		TVEEASDNCT		QECLIYGHSD
ACWMPASLDH		SSSSQAQASA		LCHSPPLSQA		STQHHSPRVT		QTIALCHSPP
VTQTIALCHS		PPPIQVSALH		HSPPLVQATA		LHHSPPSAQA		SALCYSPPLA
QAAAISHSSP		LPQVIALHRS		QAQSSVSLQQ		GWVQGADGLC		SVDQGVQGSA
TSQFYTMSER		LHPSDDSIKV		IPLTTFTPRQ		QARPSRGDSP		IMEEHPL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Yoshida K., Sugano S. (1999). Identification of a novel protocadherin gene (PCDH11) on the human XY homology region in Xq21.3. Genomics. 62: 540—543. PMID 10644456 DOI:10.1006/geno.1999.6042
• Blanco P., Sargent C.A., Boucher C., Mitchell M., Affara N. (2000). Conservation of PCDHX in mammals; expression of human X/Y genes predominantly in brain. Mamm. Genome. 11: 906—914. PMID 11003707 DOI:10.1007/s003350010177
• Blanco-Arias P., Sargent C.A., Affara N.A. (2004). Protocadherin X (PCDHX) and Y (PCDHY) genes; multiple mRNA isoforms encoding variant signal peptides and cytoplasmic domains. Mamm. Genome. 15: 41—52. PMID 14727141 DOI:10.1007/s00335-003-3028-7
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65

Див. також

• Хромосома Y