PCDH17

PCDH17
Ідентифікатори
Символи	PCDH17, PCDH68, PCH68, protocadherin 17
Зовнішні ІД	OMIM: 611760 MGI: 2684924 HomoloGene: 8700 GeneCards: PCDH17
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of postsynaptic membrane • integral component of presynaptic membrane Біологічний процес • presynaptic active zone assembly • adult behavior • regulation of synaptic vesicle clustering • negative regulation of synaptic transmission • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • synapse assembly • synaptic membrane adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27253	219228
Ensembl	ENSG00000118946	ENSMUSG00000035566
UniProt	O14917	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001040429 NM_014459	NM_001013753
RefSeq (білок)	NP_001035519	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 13: 57.63 – 57.73 Mb	Хр. 14: 84.68 – 84.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDH17 (англ. Protocadherin 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 159 амінокислот, а молекулярна маса — 126 229.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYLSICCCFL		LWAPALTLKN		LNYSVPEEQG		AGTVIGNIGR		DARLQPGLPP
AERGGGGRSK		SGSYRVLENS		APHLLDVDAD		SGLLYTKQRI		DRESLCRHNA
KCQLSLEVFA		NDKEICMIKV		EIQDINDNAP		SFSSDQIEMD		ISENAAPGTR
FPLTSAHDPD		AGENGLRTYL		LTRDDHGLFG		LDVKSRGDGT		KFPELVIQKA
LDREQQNHHT		LVLTALDGGE		PPRSATVQIN		VKVIDSNDNS		PVFEAPSYLV
ELPENAPLGT		VVIDLNATDA		DEGPNGEVLY		SFSSYVPDRV		RELFSIDPKT
GLIRVKGNLD		YEENGMLEID		VQARDLGPNP		IPAHCKVTVK		LIDRNDNAPS
IGFVSVRQGA		LSEAAPPGTV		IALVRVTDRD		SGKNGQLQCR		VLGGGGTGGG
GGLGGPGGSV		PFKLEENYDN		FYTVVTDRPL		DRETQDEYNV		TIVARDGGSP
PLNSTKSFAI		KILDENDNPP		RFTKGLYVLQ		VHENNIPGEY		LGSVLAQDPD
LGQNGTVSYS		ILPSHIGDVS		IYTYVSVNPT		NGAIYALRSF		NFEQTKAFEF
KVLAKDSGAP		AHLESNATVR		VTVLDVNDNA		PVIVLPTLQN		DTAELQVPRN
AGLGYLVSTV		RALDSDFGES		GRLTYEIVDG		NDDHLFEIDP		SSGEIRTLHP
FWEDVTPVVE		LVVKVTDHGK		PTLSAVAKLI		IRSVSGSLPE		GVPRVNGEQH
HWDMSLPLIV		TLSTISIILL		AAMITIAVKC		KRENKEIRTY		NCRIAEYSHP
QLGGGKGKKK		KINKNDIMLV		QSEVEERNAM		NVMNVVSSPS		LATSPMYFDY
QTRLPLSSPR		SEVMYLKPAS		NNLTVPQGHA		GCHTSFTGQG		TNASETPATR
MSIIQTDNFP		AEPNYMGSRQ		QFVQSSSTFK		DPERASLRDS		GHGDSDQADS
DQDTNKGSCC		DMSVREALKM		KTTSTKSQPL		EQEPEECVNC		TDECRVLGHS
DRCWMPQFPA		ANQAENADYR		TNLFVPTVEA		NVETETYETV		NPTGKKTFCT
FGKDKREHTI		LIANVKPYLK		AKRALSPLLQ		EVPSASSSPT		KACIEPCTST
KGSLDGCEAK		PGALAEASSQ		YLPTDSQYLS		PSKQPRDPPF		MASDQMARVF
ADVHSRASRD		SSEMGAVLEQ		LDHPNRDLGR		ESVDAEEVVR		EIDKLLQDCR
GNDPVAVRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13