PCDH18

PCDH18
Ідентифікатори
Символи	PCDH18, PCDH68L, protocadherin 18
Зовнішні ІД	OMIM: 608287 MGI: 1920423 HomoloGene: 10389 GeneCards: PCDH18
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • brain development • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54510	73173
Ensembl	ENSG00000189184	ENSMUSG00000037892
UniProt	Q9HCL0	Q8VHR0
RefSeq (мРНК)	NM_001300828 NM_019035	NM_130448
RefSeq (білок)	NP_001287757 NP_061908	NP_569715 NP_001391291 NP_001391292 NP_001391293 NP_001391295 NP_001391296 NP_001391306
Локус (UCSC)	Хр. 4: 137.52 – 137.53 Mb	Хр. 3: 49.7 – 49.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDH18 (англ. Protocadherin 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 135 амінокислот, а молекулярна маса — 126 149.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHQMNAKMHF		RFVFALLIVS		FNHDVLGKNL		KYRIYEEQRV		GSVIARLSED
VADVLLKLPN		PSTVRFRAMQ		RGNSPLLVVN		EDNGEISIGA		TIDREQLCQK
NLNCSIEFDV		ITLPTEHLQL		FHIEVEVLDI		NDNSPQFSRS		LIPIEISESA
AVGTRIPLDS		AFDPDVGENS		LHTYSLSAND		FFNIEVRTRT		DGAKYAELIV
VRELDRELKS		SYELQLTASD		MGVPQRSGSS		ILKISISDSN		DNSPAFEQQS
YIIQLLENSP		VGTLLLDLNA		TDPDEGANGK		IVYSFSSHVS		PKIMETFKID
SERGHLTLFK		QVDYEITKSY		EIDVQAQDLG		PNSIPAHCKI		IIKVVDVNDN
KPEININLMS		PGKEEISYIF		EGDPIDTFVA		LVRVQDKDSG		LNGEIVCKLH
GHGHFKLQKT		YENNYLILTN		ATLDREKRSE		YSLTVIAEDR		GTPSLSTVKH
FTVQINDIND		NPPHFQRSRY		EFVISENNSP		GAYITTVTAT		DPDLGENGQV
TYTILESFIL		GSSITTYVTI		DPSNGAIYAL		RIFDHEEVSQ		ITFVVEARDG
GSPKQLVSNT		TVVLTIIDEN		DNVPVVIGPA		LRNNTAEITI		PKGAESGFHV
TRIRAIDRDS		GVNAELSCAI		VAGNEENIFI		IDPRSCDIHT		NVSMDSVPYT
EWELSVIIQD		KGNPQLHTKV		LLKCMIFEYA		ESVTSTAMTS		VSQASLDVSM
IIIISLGAIC		AVLLVIMVLF		ATRCNREKKD		TRSYNCRVAE		STYQHHPKRP
SRQIHKGDIT		LVPTINGTLP		IRSHHRSSPS		SSPTLERGQM		GSRQSHNSHQ
SLNSLVTISS		NHVPENFSLE		LTHATPAVEQ		VSQLLSMLHQ		GQYQPRPSFR
GNKYSRSYRY		ALQDMDKFSL		KDSGRGDSEA		GDSDYDLGRD		SPIDRLLGEG
FSDLFLTDGR		IPAAMRLCTE		ECRVLGHSDQ		CWMPPLPSPS		SDYRSNMFIP
GEEFPTQPQQ		QHPHQSLEDD		AQPADSGEKK		KSFSTFGKDS		PNDEDTGDTS
TSSLLSEMSS		VFQRLLPPSL		DTYSECSEVD		RSNSLERRKG		PLPAKTVGYP
QGVAAWAAST		HFQNPTTNCG		PPLGTHSSVQ		PSSKWLPAME		EIPENYEEDD
FDNVLNHLND		GKHELMDASE		LVAEINKLLQ		DVRQS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wolverton T., Lalande M. (2001). Identification and characterization of three members of a novel subclass of protocadherins. Genomics. 76: 66—72. PMID 11549318 DOI:10.1006/geno.2001.6592

Див. також

• Хромосома 4