PCDH7

PCDH7
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YST
Ідентифікатори
Символи	PCDH7, BH-Pcdh, BHPCDH, PPP1R120, protocadherin 7
Зовнішні ІД	OMIM: 602988 MGI: 1860487 HomoloGene: 36101 GeneCards: PCDH7
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • platelet alpha granule membrane Біологічний процес • адгезія клітин • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • platelet degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5099	54216
Ensembl	ENSG00000169851	ENSMUSG00000029108
UniProt	O60245	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001173523 NM_002589 NM_032456 NM_032457	NM_001122758 NM_018764 NM_001310606 NM_001310608
RefSeq (білок)	NP_001166994 NP_002580 NP_115832 NP_115833	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 4: 30.72 – 31.15 Mb	Хр. 5: 57.88 – 58.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDH7 (англ. Protocadherin 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 069 амінокислот, а молекулярна маса — 116 071.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLRMRTAGWA		RGWCLGCCLL		LPLSLSLAAA		KQLLRYRLAE		EGPADVRIGN
VASDLGIVTG		SGEVTFSLES		GSEYLKIDNL		TGELSTSERR		IDREKLPQCQ
MIFDENECFL		DFEVSVIGPS		QSWVDLFEGQ		VIVLDINDNT		PTFPSPVLTL
TVEENRPVGT		LYLLPTATDR		DFGRNGIERY		ELLQEPGGGG		SGGESRRAGA
ADSAPYPGGG		GNGASGGGSG		GSKRRLDASE		GGGGTNPGGR		SSVFELQVAD
TPDGEKQPQL		IVKGALDREQ		RDSYELTLRV		RDGGDPPRSS		QAILRVLITD
VNDNSPRFEK		SVYEADLAEN		SAPGTPILQL		RAADLDVGVN		GQIEYVFGAA
TESVRRLLRL		DETSGWLSVL		HRIDREEVNQ		LRFTVMARDR		GQPPKTDKAT
VVLNIKDEND		NVPSIEIRKI		GRIPLKDGVA		NVAEDVLVDT		PIALVQVSDR
DQGENGVVTC		TVVGDVPFQL		KPASDTEGDQ		NKKKYFLHTS		TPLDYEATRE
FNVVIVAVDS		GSPSLSSNNS		LIVKVGDTND		NPPMFGQSVV		EVYFPENNIP
GERVATVLAT		DADSGKNAEI		AYSLDSSVMG		IFAIDPDSGD		ILVNTVLDRE
QTDRYEFKVN		AKDKGIPVLQ		GSTTVIVQVA		DKNDNDPKFM		QDVFTFYVKE
NLQPNSPVGM		VTVMDADKGR		NAEMSLYIEE		NNNIFSIEND		TGTIYSTMSF
DREHQTTYTF		RVKAVDGGDP		PRSATATVSL		FVMDENDNAP		TVTLPKNISY
TLLPPSSNVR		TVVATVLATD		SDDGINADLN		YSIVGGNPFK		LFEIDPTSGV
VSLVGKLTQK		HYGLHRLVVQ		VNDSGQPSQS		TTTLVHVFVN		ESVSNATAID
SQIARSLHIP		LTQDIAGDPS		YEISKQRLSI		VIGVVAGIMT		VILIILIVVM
ARYCRSKNKN		GYEAGKKDHE		DFFTPQQHDK		SKKPKKDKKN		KKSKQPLYSS
IVTVEASKPN		GQRYDSVNEK		LSDSPSMGRY		RSVNGGPGSP		DLARHYKSSS
PLPTVQLHPQ		SPTAGKKHQA		VQDLPPANTF		VGAGDNISIG		SDHCSEYSCQ
TNNKYSKQMR		LHPYITVFG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Yoshida K., Yoshitomo-Nakagawa K., Seki N., Sasaki M., Sugano S. (1998). Cloning, expression analysis, and chromosomal localization of BH-protocadherin (PCDH7), a novel member of the cadherin superfamily. Genomics. 49: 458—461. PMID 9615233 DOI:10.1006/geno.1998.5271

Див. також

• Хромосома 4