PCDH8

PCDH8
Ідентифікатори
Символи	PCDH8, ARCADLIN, PAPC, protocadherin 8
Зовнішні ІД	OMIM: 603580 MGI: 1306800 HomoloGene: 1943 GeneCards: PCDH8
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • cell projection • Міжклітинні контакти • postsynaptic membrane • клітинна мембрана • мембрана • presynaptic membrane • integral component of membrane • синапс • дендрит (нейробіологія) • integral component of plasma membrane • glutamatergic synapse • integral component of postsynaptic membrane Біологічний процес • morphogenesis of embryonic epithelium • somitogenesis • chemical synaptic transmission • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell signaling • адгезія клітин • нейробіологія розвитку • regulation of synaptic membrane adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5100	18530
Ensembl	ENSG00000136099	ENSMUSG00000036422
UniProt	O95206	Q7TSK3
RefSeq (мРНК)	NM_032949 NM_002590	NM_001042726 NM_021543
RefSeq (білок)	NP_002581 NP_116567	NP_001036191 NP_067518
Локус (UCSC)	Хр. 13: 52.84 – 52.85 Mb	Хр. 14: 80 – 80.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDH8 (англ. Protocadherin 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 070 амінокислот, а молекулярна маса — 113 019.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSPVRRWGSP		CLFPLQLFSL		CWVLSVAQSK		TVRYSTFEED		APGTVIGTLA
EDLHMKVSGD		TSFRLMKQFN		SSLLRVREGD		GQLTVGDAGL		DRERLCGQAP
QCVLAFDVVS		FSQEQFRLVH		VEVEVRDVND		HAPRFPRAQI		PVEVSEGAAV
GTRIPLEVPV		DEDVGANGLQ		TVRLAEPHSP		FRVELQTRAD		GAQCADLVLL
QELDRESQAA		YSLELVAQDG		GRPPRSATAA		LSVRVLDAND		HSPAFPQGAV
AEVELAEDAP		VGSLLLDLDA		ADPDEGPNGD		VVFAFGARTP		PEARRLFRLD
PRSGRLTLAG		PVDYERQDTY		ELDVRAQDRG		PGPRAATCKV		IVRIRDVNDN
APDIAITPLA		APGAPATSPF		AAAAAAAALG		GADASSPAGA		GTPEAGATSL
VPEGAARESL		VALVSTSDRD		SGANGQVRCA		LYGHEHFRLQ		PAYAGSYLVV
TAASLDRERI		AEYNLTLVAE		DRGAPPLRTV		RPYTVRVGDE		NDNAPLFTRP
VYEVSVRENN		PPGAYLATVA		ARDRDLGRNG		QVTYRLLEAE		VGRAGGAVST
YVSVDPATGA		IYALRSFDYE		TLRQLDVRIQ		ASDGGSPQLS		SSALVQVRVL
DQNDHAPVLV		HPAPANGSLE		VAVPGRTAKD		TVVARVQARD		ADEGANGELA
FELQQQEPRE		AFAIGRRTGE		ILLTGDLSQE		PPGRVFRALL		VISDGGRPPL
TTTATVSFVV		TAGGGRGPAA		PASAGSPERS		RPPGSRLGVS		GSVLQWDTPL
IVIIVLAGSC		TLLLAAIIAI		ATTCNRRKKE		VRKGGALREE		RPGAAGGGAS
APGSPEEAAR		GAGPRPNMFD		VLTFPGTGKA		PFGSPAADAP		PPAVAAAEVP
GSEGGSATGE		SACHFEGQQR		LRGAHAEPYG		ASPGFGKEPA		PPVAVWKGHS
FNTISGREAE		KFSGKDSGKG		DSDFNDSDSD		ISGDALKKDL		INHMQSGLWA
CTAECKILGH		SDRCWSPSCS		GPNAHPSPHP		PAQMSTFCKS		TSLPRDPLRR
DNYYQAQLPK		TVGLQSVYEK		VLHRDYDRTV		TLLSPPRPGR		LPDLQEIGVP
LYQSPPGRYL		SPKKGANENV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

• Strehl S., Glatt K., Liu Q.M., Glatt H., Lalande M. (1998). Characterization of two novel protocadherins (PCDH8 and PCDH9) localized on human chromosome 13 and mouse chromosome 14. Genomics. 53: 81—89. PMID 9787079 DOI:10.1006/geno.1998.5467
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13