PCDHA1

PCDHA1
Ідентифікатори
Символи	PCDHA1, PCDH-ALPHA1, Protocadherin alpha 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606307 MGI: 2150982 HomoloGene: 75093 GeneCards: PCDHA1
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • extracellular region • integral component of plasma membrane • мембрана • клітинна мембрана • ендоплазматичний ретикулум Біологічний процес • адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56147	116731
Ensembl	ENSG00000204970	ENSMUSG00000103442
UniProt	Q9Y5I3	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_031411 NM_018900 NM_031410	NM_054072
RefSeq (білок)	NP_061723 NP_113598 NP_113599	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 5: 140.79 – 141.01 Mb	Хр. 18: 37.06 – 37.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDHA1 (англ. Protocadherin alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 950 амінокислот, а молекулярна маса — 102 952.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVFSRRGGLG		ARDLLLWLLL		LAAWEVGSGQ		LHYSIPEEAK		HGTFVGRVAQ
DLGLELAELV		PRLFRVASKT		HRDLLEVNLQ		NGILFVNSRI		DREELCQWSA
ECSIHLELIA		DRPLQVFHVE		VKVKDINDNP		PVFRGREQII		FIPESRLLNS
RFPIEGAADA		DIGANALLTY		TLSPSDYFSL		DVEASDELSK		SLWLELRKYL
DREETPELHL		LLTATDGGKP		ELQGTVELLI		TVLDVNDNAP		LFDQAVYRVH
LLETTANGTL		VTTLNASDAD		EGVNGEVVFS		FDSGISRDIQ		EKFKVDSSSG
EIRLIDKLDY		EETKSYEIQV		KAVDKGSPPM		SNHCKVLVKV		LDVNDNAPEL
AVTSLYLPIR		EDAPLSTVIA		LITVSDRDSG		ANGQVTCSLM		PHVPFKLVST
FKNYYSLVLD		SALDRESLSV		YELVVTARDG		GSPSLWATAR		VSVEVADVND
NAPAFAQPEY		TVFVKENNPP		GCHIFTVSAR		DADAQENALV		SYSLVERRVG
ERALSNYVSV		HAESGKVYAL		QPLDHEELEL		LQFQVSARDA		GVPPLGSNVT
LQVFVLDEND		NAPALLAPRV		GGTIGAVSEL		VPRLVGAGHV		VAKVRAVDAD
SGYNAWLSYE		LQPAAGGARI		PFRVGLYTGE		ISTTRVLDEA		DLSRYRLLVL
VKDHGEPALT		ATATVLVSLV		ESGQAPKASS		RASVGVAGPE		AALVDVNVYL
IIAICAVSSL		LVLTLLLYTA		LRCSVPPTEG		AYVPGKPTLV		CSSALGSWSN
SQQRRQRVCS		SEGPPKTDLM		AFSPGLSPSL		NTSERNEQPE		ANLDLSGNPR
QPNPDWRYSA		SLRAGMHSSV		HLEEAGILRA		GPGGPDQQWP		TVSSATPEPE
AGEVSPPVGA		GVNSNSWTFK		YGPGNPKQSG		PGELPDKFII		PGSPAIISIR
QEPTNSQIDK		SDFITFGKKE		ETKKKKKKKK		GNKTQEKKEK		GNSTTDNSDQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8

Див. також

• Хромосома 5