PCDHA12

PCDHA12
Ідентифікатори
Символи	PCDHA12, PCDH-ALPHA12, protocadherin alpha 12
Зовнішні ІД	OMIM: 606318 MGI: 1298408 HomoloGene: 135720 GeneCards: PCDHA12
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56137	12943
Ensembl	ENSG00000251664	ENSMUSG00000007440
UniProt	Q9UN75	Q91Y20
RefSeq (мРНК)	NM_031864 NM_018903	NM_009961
RefSeq (білок)	NP_061726 NP_114070	NP_034091
Локус (UCSC)	Хр. 5: 140.88 – 141.01 Mb	Хр. 18: 37.14 – 37.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDHA12 (англ. Protocadherin alpha 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 941 амінокислот, а молекулярна маса — 101 652.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVIIGPRGPG		SQRLLLSLLL		LAAWEVGSGQ		LHYSVYEEAK		HGTFVGRIAQ
DLGLELAELV		PRLFRVASKR		HGDLLEVNLQ		NGILFVNSRI		DREKLCGRSA
ECSIHLEVIV		DRPLQVFHVD		VEVKDINDNP		PVFREREQKV		PVSESAPLDS
HFPLEGASDA		DIGVNSLLTY		ALSLNENFEL		KIKTKKDKSI		LPELVLRKLL
DREQTPKLNL		LLMVIDGGKP		ELTGSVQIQI		TVLDVNDNGP		AFDKPSYKVV
LSENVQNDTR		VIQLNASDPD		EGLNGEISYG		IKMILPVSEK		CMFSINPDTG
EIRIYGELDF		EENNAYEIQV		NAIDKGIPSM		AGHSMVLVEV		LDVNDNVPEV
MVTSLSLPVQ		EDAQVGTVIA		LISVSDRDSG		ANGQVICSLT		PHVPFKLVST
YKNYYSLVLD		SALDRESVSA		YELVVTARDG		GSPSLWATAR		VSVEVADVND
NAPAFAQPEY		TVFVKENNPP		GCHIFTVSAW		DADAQKNALV		SYSLVERRVG
EHALSSYVSV		HAESGKVYAL		QPLDHEELEL		LQFQVSARDA		GVPPLGSNVT
LQVFVLDEND		NAPALLATPA		GSAGGAVSEL		VPRSVGAGHV		VAKVRAVDAD
SGYNAWLSYE		LQPAAVGAHI		PFHVGLYTGE		ISTTRILDEA		DAPRHRLLVL
VKDHGEPALT		STATVLVSLV		ENGQAPKTSS		RASVGAVDPE		AALVDINVYL
IIAICAVSSL		LVLTLLLYTA		LRCSAPPTVS		RCAPGKPTLV		CSSAVGSWSY
SQQRRQRVCS		AESPPKTDLM		AFSPSLQLSR		EDCLNPPSEP		RQPNPDWRYS
ASLRAGMHSS		VHLEEAGILR		AGPGGPDQQW		PTVSSATPEP		EAGEVSPPVG
AGVNSNSWTF		KYGPGNPKQS		GPGELPDKFI		IPGSPAIISI		RQEPTNSQID
KSDFITFGKK		EETKKKKKKK		KGNKTQEKKE		KGNSTTDNSD		Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5