PCDHA2

PCDHA2
Ідентифікатори
Символи	PCDHA2, PCDH-ALPHA2, protocadherin alpha 2
Зовнішні ІД	OMIM: 606308 MGI: 2681880 HomoloGene: 135719 GeneCards: PCDHA2
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • клітинне ядро • ендоплазматичний ретикулум Біологічний процес • адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56146	353234
Ensembl	ENSG00000204969	ENSMUSG00000104148
UniProt	Q9Y5H9	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_031496 NM_018905 NM_031495	NM_198117
RefSeq (білок)	NP_061728 NP_113683 NP_113684	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 5: 140.79 – 141.01 Mb	Хр. 18: 37.07 – 37.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDHA2 (англ. Protocadherin alpha 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 948 амінокислот, а молекулярна маса — 102 063.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASSIRRGRG		AWTRLLSLLL		LAAWEVGSGQ		LRYSVPEEAK		HGTFVGRIAQ
DLGLELEELV		PRLFRVASKR		HGDLLEVNLQ		NGILFVNSRI		DREELCGRSA
ECSIHVEVIV		DRPLQVFHVE		VEVKDINDNP		PIFPMTVKTI		RFPESRLLDS
RFPLEGASDA		DIGVNALLSY		KLSSSEFFFL		DIQANDELSE		SLSLVLGKSL
DREETAEVNL		LLVATDGGKP		ELTGTVQILI		KVLDVNDNEP		TFAQSVYKVK
LLENTANGTL		VVKLNASDAD		EGPNSEIVYS		LGSDVSSTIQ		TKFTIDPISG
EIRTKGKLDY		EEAKSYEIQV		TATDKGTPSM		SGHCKISLKL		VDINDNTPEV
SITSLSLPIS		ENASLGTVIA		LITVSDRDSG		TNGHVTCSLT		PHVPFKLVST
FKNYYSLVLD		SALDRESVSA		YELVVTARDG		GSPSLWATTS		VSIEVADVND
NAPAFAQPEY		TVFVKENNPP		GCHIFTVSAW		DADAQENALV		SYSLVERRVG
ERALSSYVSV		HAESGKVYAL		QPLDHEEVEL		LQFQVSARDA		GVPPLGSNVT
LQVFVLDEND		NAPALLAPRA		GTAAGAVSEL		VPWSVGAGHV		VAKVRAVDAD
SGYNAWLSYE		LQLGTGSARI		PFRVGLYTGE		ISTTRALDEA		DSPRHRLLVL
VKDHGEPALT		ATATVLVSLV		ESGQAPKASS		RAWVGAAGSE		ATLVDVNVYL
IIAICAVSSL		LVLTVLLYTA		LRCSVPPTEG		ARAPGKPTLV		CSSAVGSWSY
SQQRRQRVCS		GEDPPKTDLM		AFSPSLSQGP		DSAEEKQLSE		SEYVGKPRQP
NPDWRYSASL		RAGMHSSVHL		EEAGILRAGP		GGPDQQWPTV		SSATPEPEAG
EVSPPVGAGV		NSNSWTFKYG		PGNPKQSGPG		ELPDKFIIPG		SPAIISIRQE
PTNSQIDKSD		FITFGKKEET		KKKKKKKKGN		KTQEKKEKGN		STTDNSDQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5