PCDHA6

PCDHA6
Ідентифікатори
Символи	PCDHA6, CNR2, CNRN2, CNRS2, CRNR2, PCDH-ALPHA6, protocadherin alpha 6
Зовнішні ІД	OMIM: 606312 MGI: 1298367 HomoloGene: 75098 GeneCards: PCDHA6
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • extracellular region • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана Біологічний процес • адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56142	12937
Ensembl	ENSG00000081842	ENSMUSG00000103707
UniProt	Q9UN73	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_031849 NM_018909 NM_031848	NM_007767
RefSeq (білок)	NP_061732 NP_114036 NP_114037	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 5: 140.83 – 141.01 Mb	Хр. 18: 37.1 – 37.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDHA6 (англ. Protocadherin alpha 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 950 амінокислот, а молекулярна маса — 102 716.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVFTPEDRLG		KQCLLLPLLL		LAAWKVGSGQ		LHYSVPEEAK		HGTFVGRIAQ
DLGLELAELV		PRLFRMASKD		REDLLEVNLQ		NGILFVNSRI		DREELCGRSA
ECSIHLEVIV		DRPLQVFHVD		VEVRDINDNP		PLFPVEEQRV		LIYESRLPDS
VFPLEGASDA		DVGSNSILTY		KLSSSEYFGL		DVKINSDDNK		QIGLLLKKSL
DREEAPAHNL		FLTATDGGKP		ELTGTVQLLV		TVLDVNDNAP		TFEQSEYEVR
IFENADNGTT		VIRLNASDRD		EGANGAISYS		FNSLVAAMVI		DHFSIDRNTG
EIVIRGNLDF		EQENLYKILI		DATDKGHPPM		AGHCTVLVRI		LDKNDNVPEI
ALTSLSLPVR		EDAQFGTVIA		LISVNDLDSG		ANGQVNCSLT		PHVPFKLVST
FKNYYSLVLD		SALDRESVSA		YELVVTARDG		GSPSLWATAS		LSVEVADMND
NAPAFAQPEY		TVFVKENNPP		GCHIFTVSAR		DADAQENALV		SYSLVERRVG
ERALSSYISV		HAESGKVYAL		QPLDHEELEL		LQFQVSARDA		GVPPLGSNVT
LQVFVLDEND		NAPALLAPRV		GGTGGAVSEL		VPRSLGAGQV		VAKVRAVDAD
SGYNAWLSYE		LQPPASSARF		PFRVGLYTGE		ISTTRVLDEA		DSPRHRLLVL
VKDHGEPALT		ATATVLVSLV		ESGQAPKASS		RASVGAAGPE		AALVDVNVYL
IIAICAVSSL		LVLTLLLYTA		LRCSAPPTEG		ACTADKPTLV		CSSAVGSWSY
SQQRRQRVCS		GEGPPKMDLM		AFSPSLSPCP		IMMGKAENQD		LNEDHDAKPR
QPNPDWRYSA		SLRAGMHSSV		HLEEAGILRA		GPGGPDQQWP		TVSSATPEPE
AGEVSPPVGA		GVNSNSWTFK		YGPGNPKQSG		PGELPDKFII		PGSPAIISIR
QEPTNSQIDK		SDFITFGKKE		ETKKKKKKKK		GNKTQEKKEK		GNSTTDNSDQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5