PCDHA9

PCDHA9
Ідентифікатори
Символи	PCDHA9, PCDH-ALPHA9, protocadherin alpha 9
Зовнішні ІД	OMIM: 606315 MGI: 2681879 HomoloGene: 129614 GeneCards: PCDHA9
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9752	353235
Ensembl	ENSG00000204961	ENSMUSG00000103800
UniProt	Q9Y5H5	Q91Y12
RefSeq (мРНК)	NM_031857 NM_014005	NM_201243
RefSeq (білок)	NP_054724 NP_114063	NP_957695
Локус (UCSC)	Хр. 5: 140.85 – 141.01 Mb	Хр. 18: 37.13 – 37.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDHA9 (англ. Protocadherin alpha 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 950 амінокислот, а молекулярна маса — 102 402.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLYSSRGDPE		GQPLLLSLLI		LAMWVVGSGQ		LHYSVPEEAE		HGTFVGRIAQ
DLGLELAELV		PRLFQLDSKG		RGDLLEVNLQ		NGILFVNSRI		DREELCGRSA
ECSIHLEVIV		DRPLQVFHVD		VEVKDINDNP		PVFPATQKNL		FIAESRPLDS
RFPLEGASDA		DIGENALLTY		RLSPNEYFFL		DVPTSNQQVK		PLGLVLRKLL
DREETPELHL		LLTATDGGKP		ELTGTVQLLI		TVLDNNDNAP		VFDRTLYTVK
LPENVSIGTL		VIHPNASDLD		EGLNGDIIYS		FSSDVSPDIK		SKFHMDPLSG
AITVIGHMDF		EESRAHKIPV		EAVDKGFPPL		AGHCTLLVEV		VDVNDNAPQL
TIKTLSVPVK		EDAQLGTVIA		LISVIDLDAD		ANGQVTCSLT		PHVPFKLVST
YKNYYSLVLD		RALDRESVSA		YELVVTARDG		GSPSLWATAR		VSVEVADVND
NAPAFAQSEY		TVFVKENNPP		GCHIFTVSAR		DADAQENALV		SYSLVERRLG
ERSLSSYVSV		HAESGKVYAL		QPLDHEELEL		LQFQVSARDA		GVPPLGSNVT
LQVFVLDEND		NAPALLTPRM		RGTDGAVSEM		VLRSVGAGVV		VGKVRAVDAD
SGYNAWLSYE		LQPETASASI		PFRVGLYTGE		ISTTRALDET		DAPRQRLLVL
VKDHGEPALT		ATATVLVSLV		ESGQAPKSSS		RASVGATGPE		VTLVDVNVYL
IIAICAVSSL		LVLTLLLYTV		LRCSAMPTEG		ECAPGKPTLV		CSSAVGSWSY
SQQRRQRVCS		GEGKQKTDLM		AFSPGLSPCA		GSTERTGEPS		ASSDSTGKPR
QPNPDWRYSA		SLRAGMHSSV		HLEEAGILRA		GPGGPDQQWP		TVSSATPEPE
AGEVSPPVGA		GVNSNSWTFK		YGPGNPKQSG		PGELPDKFII		PGSPAIISIR
QEPTNSQIDK		SDFITFGKKE		ETKKKKKKKK		GNKTQEKKEK		GNSTTDNSDQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5