PCDHB11

PCDHB11
Ідентифікатори
Символи	PCDHB11, ME2, PCDH-BETA11, protocadherin beta 11
Зовнішні ІД	OMIM: 606337 MGI: 2136759 HomoloGene: 134302 GeneCards: PCDHB11
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана Біологічний процес • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • synapse assembly • адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • chemical synaptic transmission Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56125	93892
Ensembl	ENSG00000197479	ENSMUSG00000044022
UniProt	Q9Y5F2	Q91V48
RefSeq (мРНК)	NM_018931	NM_053146
RefSeq (білок)	NP_061754	NP_444376
Локус (UCSC)	Хр. 5: 141.2 – 141.2 Mb	Хр. 18: 37.65 – 37.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDHB11 (англ. Protocadherin beta 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 797 амінокислот, а молекулярна маса — 87 088.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MENQGTRTQQ		IRQVLLLFVL		LGMSQAGSET		WSFSVAEEMQ		SGSFVGNLAK
DLGLKVRELS		SRGARVVSND		KKQRLQLDIN		TGDLLLSETL		DREELCGSIE
PCVLHLQVLM		QNPTQFLQIE		LQVRDINDHS		PIFSEKQMLL		EIPENSPVGA
VFLLESAKDL		DVGINAVKSY		TISPNSHFHI		KMRVIPDNRK		YPELVLDKAL
DYEELPELSF		ILSALDGGSP		PRSGTALVRV		VVVDINDNSP		EFEQAFYEVK
IRENSILGSL		ILIVSAWDLD		SGTNGEICYT		FSHASEDIRK		TFEINQKSGE
ITLRAPLDFE		TIESYSIIIQ		ATDGGGLFGK		STVIIHVIDV		NDNAPEITVS
SITSPIPENT		PETVVMVFSI		QDIDSGDNGR		IVCSIPEDLP		FVLKSSVENY
YTLETERPLD		RESTAEYNIT		ITVTDLGIPR		LKTEHNTTVL		VSDVNDNAPT
FTQTSYTLFV		RENNSPALHI		GSVSATDRDS		GTNAQVNYSL		LPPQDLHLPL
ASLVSINTDN		GHLFALRSLD		YEALQAFDFR		VGATDRGSPA		LSSEALVRVL
VLDANDNSPF		VLYPLQNGSA		PCTELVPRAA		EPGYLVTKVV		AVDGDSGQNA
WLSYQLLKAT		EPGLFGVWAH		NGEVRTARLL		SERDAAKHRL		VVLVKDNGEP
PRSATATLQV		LLVDGFSQPY		LPLPEAAPAQ		AQADSLTVYL		VVALASVSSL
FLFSVLLFVA		VRLCRRSRAA		SVGSCSVPKG		PFPGHLVDVS		GTGTLSQSYQ
YEVCLTGGSE		TNEFKFLKPV		IPNIQAKGLG		KNSEENSTFR		NSFGFNF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
• Vanhalst K., Kools P., Vanden Eynde E., van Roy F. (2001). The human and murine protocadherin-beta one-exon gene families show high evolutionary conservation, despite the difference in gene number. FEBS Lett. 495: 120—125. PMID 11322959 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02372-9
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5