PCDHB12

PCDHB12
Ідентифікатори
Символи	PCDHB12, PCDH-BETA12, protocadherin beta 12
Зовнішні ІД	OMIM: 606338 MGI: 2136757 HomoloGene: 128411 GeneCards: PCDHB12
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана Біологічний процес • адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • chemical synaptic transmission • synapse assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56124	93890
Ensembl	ENSG00000120328	ENSMUSG00000043313
UniProt	Q9Y5F1	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_018932	NM_053144
RefSeq (білок)	NP_061755	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 5: 141.21 – 141.21 Mb	Хр. 18: 37.63 – 37.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDHB12 (англ. Protocadherin beta 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 795 амінокислот, а молекулярна маса — 86 770.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MENGGAGTLQ		IRQVLLFFVL		LGMSQAGSET		GNFLVMEELQ		SGSFVGNLAK
TLGLEVSELS		SRGARVVSND		NKECLQLDTN		TGDLLLREML		DREELCGSNE
PCVLYFQVLM		KNPTQFLQIE		LQVRDINDHS		PVFLEKEMLL		EIPENSPVGA
VFLLESAKDL		DVGINAVKSY		TINPNSHFHV		KIRVNPDNRK		YPELVLDKAL
DYEERPELSF		ILTALDGGSP		PRSGTALVRV		VVVDINDNSP		EFEQAFYEVK
ILENSILGSL		VVTVSAWDLD		SGTNSELSYT		FSHASEDIRK		TFEINQKSGD
ITLTAPLDFE		AIESYSIIIQ		ATDGGGLFGK		STVRIQVMDV		NDNAPEITVS
SITSPIPENT		PETVVMVFRI		RDRDSGDNGK		MVCSIPEDIP		FVLKSSVNNY
YTLETERPLD		RESRAEYNIT		ITVTDLGTPR		LKTEHNITVL		VSDVNDNAPA
FTQTSYALFV		RENNSPALHI		GSISATDRDS		GTNAQVNYSL		LPSQDPHLPL
ASLVSINADN		GHLFALRSLD		YEALQGFQFR		VGATDHGSPA		LSSEALVRVL
VLDANDNSPF		VLYPLQNGSA		PCTELVPWAA		EPGYLVTKVV		AVDGDSGQNA
WLSYQLLKAT		EPGLFGVWAH		NGEVRTARLL		SERDAAKHRL		VVLVKDNGEP
PRSATATLHV		LLVDGFSQPY		LPLPEAAPAQ		AQADSLTVYL		VVALASVSSL
FLFSVLLFVA		VRLCRRSRAA		PVGRCSVPEG		PFPGHLVDVS		GTGTLSQSYH
YEVCVTGGSR		SNKFKFLKPI		IPNFLPQSTG		SEVEENPPFQ		NNLGF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
• Vanhalst K., Kools P., Vanden Eynde E., van Roy F. (2001). The human and murine protocadherin-beta one-exon gene families show high evolutionary conservation, despite the difference in gene number. FEBS Lett. 495: 120—125. PMID 11322959 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02372-9
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5