PCDHB13

PCDHB13
Ідентифікатори
Символи	PCDHB13, PCDH-BETA13, protocadherin beta 13
Зовнішні ІД	OMIM: 606339 HomoloGene: 128504 GeneCards: PCDHB13
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • клітинна мембрана • мембрана • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • photoreceptor connecting cilium • синапс • postsynaptic membrane • photoreceptor disc membrane Біологічний процес • chemical synaptic transmission • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • synapse assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • адгезія клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56123	н/д
Ensembl	ENSG00000187372	н/д
UniProt	Q9Y5F0	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_018933	н/д
RefSeq (білок)	NP_061756	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 5: 141.21 – 141.22 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

PCDHB13 (англ. Protocadherin beta 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 798 амінокислот, а молекулярна маса — 87 552.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEASGKLICR		QRQVLFSFLL		LGLSLAGAAE		PRSYSVVEET		EGSSFVTNLA
KDLGLEQREF		SRRGVRVVSR		GNKLHLQLNQ		ETADLLLNEK		LDREDLCGHT
EPCVLRFQVL		LESPFEFFQA		ELQVIDINDH		SPVFLDKQML		VKVSESSPPG
TTFPLKNAED		LDVGQNNIEN		YIISPNSYFR		VLTRKRSDGR		KYPELVLDKA
LDREEEAELR		LTLTALDGGS		PPRSGTAQVY		IEVLDVNDNA		PEFEQPFYRV
QISEDSPVGF		LVVKVSATDV		DTGVNGEISY		SLFQASEEIG		KTFKINPLTG
EIELKKQLDF		EKLQSYEVNI		EARDAGTFSG		KCTVLIQVID		VNDHAPEVTM
SAFTSPIPEN		APETVVALFS		VSDLDSGENG		KISCSIQEDL		PFLLKSAENF
YTLLTERPLD		RESRAEYNIT		ITVTDLGTPM		LITQLNMTVL		IADVNDNAPA
FTQTSYTLFV		RENNSPALHI		RSVSATDRDS		GTNAQVTYSL		LPPQDPHLPL
TSLVSINADN		GHLFALRSLD		YEALQGFQFR		VGASDHGSPA		LSSEALVRVV
VLDANDNSPF		VLYPLQNGSA		PCTELVPRAA		EPGYLVTKVV		AVDGDSGQNA
WLSYQLLKAT		ELGLFGVWAH		NGEVRTARLL		SERDAAKHRL		VVLVKDNGEP
PRSATATLHV		LLVDGFSQPY		LPLPEAAPTQ		AQADLLTVYL		VVALASVSSL
FLFSVLLFVA		VRLCRRSRAA		SVGRCLVPEG		PLPGHLVDMS		GTRTLSQSYQ
YEVCLAGGSG		TNEFKFLKPI		IPNFPPQCPG		KEIQGNSTFP		NNFGFNIQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
• Vanhalst K., Kools P., Vanden Eynde E., van Roy F. (2001). The human and murine protocadherin-beta one-exon gene families show high evolutionary conservation, despite the difference in gene number. FEBS Lett. 495: 120—125. PMID 11322959 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02372-9
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5