PCDHGA11

PCDHGA11
Ідентифікатори
Символи	PCDHGA11, PCDH-GAMMA-A11, protocadherin gamma subfamily A, 11
Зовнішні ІД	OMIM: 606298 MGI: 1935228 HomoloGene: 110934 GeneCards: PCDHGA11
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56105	93723
Ensembl	ENSG00000253873	ENSMUSG00000102742
UniProt	Q9Y5H2	Q91XY8
RefSeq (мРНК)	NM_032092 NM_018914 NM_032091	NM_033594
RefSeq (білок)	NP_061737 NP_114480 NP_114481	NP_291072
Локус (UCSC)	Хр. 5: 141.42 – 141.51 Mb	Хр. 18: 37.89 – 37.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDHGA11 (англ. Protocadherin gamma subfamily A, 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 935 амінокислот, а молекулярна маса — 101 543.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MANRLQRGDR		SRLLLLLCIF		LGTLRGFRAR		QIRYSVPEET		EKGSFVGNIS
KDLGLEPREL		AKRGVRIVSR		GKTQLFAVNP		RSGSLITAGR		IDREELCETV
SSCFLNMELL		VEDTLKIYGV		EVEIIDINDN		APSFQEDEVE		IKVSEHAIPG
ARFALPNARD		PDVGVNSLQS		YQLSPNNYFS		LQLRGRTDGA		KNPELVLEGS
LDREKEAAHL		LLLTALDGGD		PIRKGAVPIR		VVVLDVNDHI		PMFTQSVYRV
SVPENISSGT		RVLMVNATDP		DEGINGEVMY		SFRNMESKAS		EIFQLDSQTG
EVQVRGSLDF		EKYRFYEMEI		QGQDGGGLFT		TTTMLITVVD		VNDNAPEITI
TSSINSILEN		SPPGTVIALL		NVQDQDSGEN		GQVSCFIPNH		LPFKLEKTYG
NYYKLITSRV		LDRELVQSYN		ITLTATDQGS		PPLSAETHVW		LNVADDNDNP
PVFPHSSYSA		YIPENNPRGA		SIFSVTALDP		DSKQNALVTY		SLTDDTVQGV
PLSSYVSINS		NTGVLYALQS		FDYEQFRDLE		LRVIARDSGD		PPLSSNVSLS
LFVLDQNDNA		PEILYPALPT		DGSTGVELAP		RSAEPGYLVT		KVVAVDKDSG
QNAWLSYRLL		KASEPGLFAV		GEHTGEVRTA		RALLDRDALK		QSLVVAVQDH
GQPPLSATVT		LTVAVADSIP		EVLADLGSLE		SLANSETSDL		SLYLVVAVAA
VSCIFLVFVI		VLLALRLWRW		HKSRLLQASE		GGLAGMPTSH		FVGVDGVQAF
LQTYSHEVSL		IADSQKSHLI		FPQPNYGDTL		ISQESCEKSE		PLLIAEDSAI
ILGKCDPTSN		QQAPPNTDWR		FSQAQRPGTS		GSQNGDDTGT		WPNNQFDTEM
LQAMILASAS		EAADGSSTLG		GGAGTMGLSA		RYGPQFTLQH		VPDYRQNVYI
PGSNATLTNA		AGKRDGKAPA		GGNGNKKKSG		KKEKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5