PCDHGB6

PCDHGB6
Ідентифікатори
Символи	PCDHGB6, PCDH-GAMMA-B6, protocadherin gamma subfamily B, 6
Зовнішні ІД	OMIM: 606303 MGI: 1935197 HomoloGene: 49573 GeneCards: PCDHGB6
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • клітинна мембрана • мембрана • integral component of membrane • integral component of plasma membrane Біологічний процес • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56100	93703
Ensembl	ENSG00000253305	ENSMUSG00000103088
UniProt	Q9Y5F9	Q91XX4
RefSeq (мРНК)	NM_032100 NM_018926 NM_001386906	NM_033578
RefSeq (білок)	NP_061749 NP_115271	NP_291056
Локус (UCSC)	Хр. 5: 141.41 – 141.51 Mb	Хр. 18: 37.88 – 37.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDHGB6 (англ. Protocadherin gamma subfamily B, 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 930 амінокислот, а молекулярна маса — 101 043.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGGSCAQRRR		AGPRQVLFPL		LLPLFYPTLS		EPIRYSIPEE		LAKGSVVGNL
AKDLGLSVLD		VSARKLRVSA		EKLHFSVDAE		SGDLLVKNRI		DREQICKERR
RCELQLEAVV		ENPLNIFHVI		VVIEDVNDHA		PQFDKKEIHL		EIFESASAGT
RLSLDPATDP		DININSIKDY		KINSNPYFSL		MVRVNSDGGK		YPELSLEKLL
DREEQRSHSL		ILTALDGGDP		PRSATAHIEI		SVKDTNDNPP		VFSRDEYRIS
LSENLPPGSP		VLQVTATDQD		EGVNAEINYY		FRSTAQSTKH		MFSLDEKTGM
IKNNQSFDFE		DVERYTMEVE		AKDGGGLSTQ		CKVIIEILDE		NDNSPEIIIT
SLSDQILENS		PPGMVVALFK		TRDLDFGGNG		EVRCNIETDI		PFKIYSSSNN
YYKLVTDGAL		DREQTPEYNV		TIVATDRGKP		PLSSSRSITL		YVADINDNAP
VFDQTSYVVH		VAENNPPGAS		IAQVSASDPD		LGLNGHISYS		IVASDLEPLA
VSSYVSVSAQ		SGVVFAQRAF		DHEQLRAFAL		TLQARDHGSP		TLSANVSLRV
LVGDRNDNAP		RVLYPALGPD		GSAFFDMVPR		SAEPGYLVTK		VVAVDADSGH
NAWLSYHVLQ		ASEPGLFSLG		LRTGEVRTAR		ALGDRDAARQ		RLLVAVRDGG
QPPLSATATL		HLVFADNLQE		ILPDLSDRPV		LSDPQAELQF		YLVVALALIS
VLFLLAVILA		IALRLRRSLS		PATWDCFHPG		LCVKSGPVVP		PNYSEGTLPY
SYNLCIAHTG		TKEFNFLKCS		VPLHSNEDMV		CSVSPGALIP		PHGGEDLTSH
PETLTSQAPP		NTDWRFSQAQ		RPGTSGSQNG		DDTGTWPNNQ		FDTEMLQAMI
LASASEAADG		SSTLGGGAGT		MGLSARYGPQ		FTLQHVPDYR		QNVYIPGSNA
TLTNAAGKRD		GKAPAGGNGN		KKKSGKKEKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8

Див. також

• Хромосома 5