PCDHGC5

PCDHGC5
Ідентифікатори
Символи	PCDHGC5, PCDH-GAMMA-C5, protocadherin gamma subfamily C, 5
Зовнішні ІД	OMIM: 606306 MGI: 1935205 HomoloGene: 110933 GeneCards: PCDHGC5
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку • synapse organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56097	93708
Ensembl	ENSG00000240764	ENSMUSG00000102543
UniProt	Q9Y5F6	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_032407 NM_018929	NM_033583
RefSeq (білок)	NP_061752 NP_115783	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 5: 141.49 – 141.51 Mb	Хр. 18: 37.95 – 37.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDHGC5 (англ. Protocadherin gamma subfamily C, 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 944 амінокислот, а молекулярна маса — 101 921.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGPKTLPQLA		GKWQVLCMLS		LCCWGWVSGQ		LRYSVVEESE		PGTLVGNVAQ
DLGLKMTDLL		SRRLQLGSEE		NGRYFSLSLM		SGALAVNQKI		DRESLCGAST
SCLLPVQVVT		EHPLELIRVE		VEILDLNDNS		PSFATPEREM		RISESAASGA
RFPLDSAQDP		DVGTNTVSFY		TLSPNSHFSL		NVKTLKDGKP		FPELVLEQQL
DREAQARHQL		VLTAVDGGTP		ARSGTTLISV		IVLDINDNAP		TFQSSVLRVG
IPENAPIGTL		LLRLNATDPD		EGTNGQLDYS		FGDHTSEAVR		NLFGLDPSSG
AIHVLGPIDF		EESRFYEIHA		RARDQGQPAM		EGHCVIQVDV		GDVNDNAPEV
LLASLANPVL		ESTPVGTVVG		LFNVRDRDSG		RNGEVSLDIS		PDLPFQIKPS
ENHYSLLTSQ		PLDREATSHY		IIELLASDAG		SPSLHKHLTI		RLNISDVNDN
APRFNQQLYT		AYILENRPPG		SLLCTVAASD		PDTGDNARLT		YSIVGNQVQG
APASSFVYVN		PEDGRIFAQR		TFDYELLQML		QIVVGVRDSG		SPPLHANTSL
HVFVLDENDN		APAVLHPRPD		WEHSAPQRLP		RSAPPGSLVT		KVTAVDADAG
HNAWLSYSLL		PQSTAPGLFL		VSTHTGEVRT		ARALLEDDSD		TQQVVVLVRD
NGDPSLSSTA		TVLLVLEDED		PEEMPKSSDF		LIHPPERSDL		TLYLIVALAT
VSLLSLVTFT		FLSAKCLQGN		ADGDGGGGQC		CRRQDSPSPD		FYKQSSPNLQ
VSSDGTLKYM		EVTLRPTDSQ		SHCYRTCFSP		ASDGSDFTFL		RPLSVQQPTA
LALEPDAIRS		RSNTLRERSQ		QAPPNTDWRF		SQAQRPGTSG		SQNGDDTGTW
PNNQFDTEML		QAMILASASE		AADGSSTLGG		GAGTMGLSAR		YGPQFTLQHV
PDYRQNVYIP		GSNATLTNAA		GKRDGKAPAG		GNGNKKKSGK		KEKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8

Див. також

• Хромосома 5