PCOLCE

PCOLCE
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UAP
Ідентифікатори
Символи	PCOLCE, PCPE, PCPE-1, PCPE1, procollagen C-endopeptidase enhancer
Зовнішні ІД	OMIM: 600270 MGI: 105099 HomoloGene: 1946 GeneCards: PCOLCE
Онтологія гена Молекулярна функція • heparin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • peptidase activator activity • collagen binding • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця • екзосома • міжклітинний простір • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • multicellular organism development • протеоліз • positive regulation of peptidase activity • cellular response to leukemia inhibitory factor Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5118	18542
Ensembl	ENSG00000106333	ENSMUSG00000029718
UniProt	Q15113	Q61398
RefSeq (мРНК)	NM_002593	NM_008788
RefSeq (білок)	NP_002584	NP_032814
Локус (UCSC)	Хр. 7: 100.6 – 100.61 Mb	Хр. 5: 137.6 – 137.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCOLCE (англ. Procollagen C-endopeptidase enhancer) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 449 амінокислот, а молекулярна маса — 47 972.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLPAATASLL		GPLLTACALL		PFAQGQTPNY		TRPVFLCGGD		VKGESGYVAS
EGFPNLYPPN		KECIWTITVP		EGQTVSLSFR		VFDLELHPAC		RYDALEVFAG
SGTSGQRLGR		FCGTFRPAPL		VAPGNQVTLR		MTTDEGTGGR		GFLLWYSGRA
TSGTEHQFCG		GRLEKAQGTL		TTPNWPESDY		PPGISCSWHI		IAPPDQVIAL
TFEKFDLEPD		TYCRYDSVSV		FNGAVSDDSR		RLGKFCGDAV		PGSISSEGNE
LLVQFVSDLS		VTADGFSASY		KTLPRGTAKE		GQGPGPKRGT		EPKVKLPPKS
QPPEKTEESP		SAPDAPTCPK		QCRRTGTLQS		NFCASSLVVT		ATVKSMVREP
GEGLAVTVSL		IGAYKTGGLD		LPSPPTGASL		KFYVPCKQCP		PMKKGVSYLL
MGQVEENRGP		VLPPESFVVL		HRPNQDQILT		NLSKRKCPSQ		PVRAAASQD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Секретований назовні.

Література

• Scott I.C., Clark T.G., Takahara K., Hoffman G.G., Greenspan D.S. (1999). Structural organization and expression patterns of the human and mouse genes for the type I procollagen COOH-terminal proteinase enhancer protein. Genomics. 55: 229—234. PMID 9933570 DOI:10.1006/geno.1998.5663
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7