PDE1B

PDE1B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1TAZ, 4NPV, 4NPW, 5B25
Ідентифікатори
Символи	PDE1B, PDE1B1, PDES1B, HEL-S-79p, phosphodiesterase 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 171891 MGI: 97523 HomoloGene: 37370 GeneCards: PDE1B
Реагує на сполуку
	SCH-51866
Онтологія гена
Молекулярна функція	• 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity; • зв'язування з іоном металу; • calmodulin binding; • cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity; • calmodulin-dependent cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • phosphoric diester hydrolase activity; • hydrolase activity; • calcium- and calmodulin-regulated 3',5'-cyclic-GMP phosphodiesterase activity; • 3',5'-cyclic-AMP phosphodiesterase activity; • 3',5'-cyclic-GMP phosphodiesterase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • neuronal cell body; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• visual learning; • regulation of neurotransmitter levels; • cAMP catabolic process; • locomotory behavior; • response to amphetamine; • serotonin metabolic process; • monocyte differentiation; • regulation of dopamine metabolic process; • cellular response to macrophage colony-stimulating factor stimulus; • cGMP catabolic process; • cellular response to granulocyte macrophage colony-stimulating factor stimulus; • GO:0097285 апоптоз; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • G protein-coupled receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5153
	18574
	ENSG00000123360
	ENSMUSG00000022489
	Q01064
	Q01065
NM_000924; NM_001165975; NM_001288768; NM_001288769; NM_001315534;
	NM_001315535
	NM_001285890; NM_008800; NM_001357980
NP_000915; NP_001159447; NP_001275697; NP_001275698; NP_001302463;
	NP_001302464
	NP_001272819; NP_032826; NP_001344909
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PDE1B (англ. Phosphodiesterase 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 536 амінокислот, а молекулярна маса — 61 380^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MELSPRSPPE	MLEESDCPSP	LELKSAPSKK	MWIKLRSLLR	YMVKQLENGE
INIEELKKNL	EYTASLLEAV	YIDETRQILD	TEDELQELRS	DAVPSEVRDW
LASTFTQQAR	AKGRRAEEKP	KFRSIVHAVQ	AGIFVERMFR	RTYTSVGPTY
STAVLNCLKN	LDLWCFDVFS	LNQAADDHAL	RTIVFELLTR	HNLISRFKIP
TVFLMSFLDA	LETGYGKYKN	PYHNQIHAAD	VTQTVHCFLL	RTGMVHCLSE
IELLAIIFAA	AIHDYEHTGT	TNSFHIQTKS	ECAIVYNDRS	VLENHHISSV
FRLMQDDEMN	IFINLTKDEF	VELRALVIEM	VLATDMSCHF	QQVKTMKTAL
QQLERIDKPK	ALSLLLHAAD	ISHPTKQWLV	HSRWTKALME	EFFRQGDKEA
ELGLPFSPLC	DRTSTLVAQS	QIGFIDFIVE	PTFSVLTDVA	EKSVQPLADE
DSKSKNQPSF	QWRQPSLDVE	VGDPNPDVVS	FRSTWVKRIQ	ENKQKWKERA
ASGITNQMSI	DELSPCEEEA	PPSPAEDEHN	QNGNLD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, іонами металів. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Jiang X., Li J., Paskind M., Epstein P.M. (1996). Inhibition of calmodulin-dependent phosphodiesterase induces apoptosis in human leukemic cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 11236—11241. PMID 8855339 DOI:10.1073/pnas.93.20.11236
Fidock M.D., Miller M., Lanfear J. (2002). Isolation and differential tissue distribution of two human cDNAs encoding PDE1 splice variants. Cell. Signal. 14: 53—60. PMID 11747989 DOI:10.1016/S0898-6568(01)00207-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Repaske D.R., Swinnen J.V., Jin S.-L.C., van Wyk J.J., Conti M. (1992). A polymerase chain reaction strategy to identify and clone cyclic nucleotide phosphodiesterase cDNAs. Molecular cloning of the cDNA encoding the 63-kDa calmodulin-dependent phosphodiesterase. J. Biol. Chem. 267: 18683—18688. PMID 1326532

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Phosphodiesterase 1B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8775 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q01064 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Phosphodiesterase 1B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8775 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q01064 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

PDE1B

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук