PDE3B

PDE3B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1SO2, 1SOJ
Ідентифікатори
Символи	PDE3B, HcGIP1, cGIPDE1, phosphodiesterase 3B
Зовнішні ІД	OMIM: 602047 MGI: 1333863 HomoloGene: 709 GeneCards: PDE3B
Реагує на сполуку
cilostamide, Цилостазол, guanosine cyclic 3',5'-phosphate, Амрінон, Мілринон, Левосимендан
Онтологія гена Молекулярна функція • cGMP-inhibited cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity • зв'язування з іоном металу • protein kinase B binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphoric diester hydrolase activity • hydrolase activity • 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity • 3',5'-cyclic-AMP phosphodiesterase activity • 3',5'-cyclic-GMP phosphodiesterase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • guanyl-nucleotide exchange factor complex Біологічний процес • negative regulation of cell adhesion • cAMP catabolic process • negative regulation of cAMP-mediated signaling • Ангіогенез • cellular response to insulin stimulus • negative regulation of angiogenesis • negative regulation of lipid catabolic process • negative regulation of cell adhesion mediated by integrin • GO:0072468 сигнальна трансдукція • G protein-coupled receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5140	18576
Ensembl	ENSG00000152270	ENSMUSG00000030671
UniProt	Q13370	Q61409
RefSeq (мРНК)	NM_000922 NM_001363569 NM_001363570	NM_011055
RefSeq (білок)	NP_000913 NP_001350498 NP_001350499	NP_035185
Локус (UCSC)	Хр. 11: 14.64 – 14.87 Mb	Хр. 7: 114.01 – 114.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDE3B (англ. Phosphodiesterase 3B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 112 амінокислот, а молекулярна маса — 124 333.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRRDERDAKA		MRSLQPPDGA		GSPPESLRNG		YVKSCVSPLR		QDPPRGFFFH
LCRFCNVELR		PPPASPQQPR		RCSPFCRARL		SLGALAAFVL		ALLLGAEPES
WAAGAAWLRT		LLSVCSHSLS		PLFSIACAFF		FLTCFLTRTK		RGPGPGRSCG
SWWLLALPAC		CYLGDFLVWQ		WWSWPWGDGD		AGSAAPHTPP		EAAAGRLLLV
LSCVGLLLTL		AHPLRLRHCV		LVLLLASFVW		WVSFTSLGSL		PSALRPLLSG
LVGGAGCLLA		LGLDHFFQIR		EAPLHPRLSS		AAEEKVPVIR		PRRRSSCVSL
GETAASYYGS		CKIFRRPSLP		CISREQMILW		DWDLKQWYKP		HYQNSGGGNG
VDLSVLNEAR		NMVSDLLTDP		SLPPQVISSL		RSISSLMGAF		SGSCRPKINP
LTPFPGFYPC		SEIEDPAEKG		DRKLNKGLNR		NSLPTPQLRR		SSGTSGLLPV
EQSSRWDRNN		GKRPHQEFGI		SSQGCYLNGP		FNSNLLTIPK		QRSSSVSLTH
HVGLRRAGVL		SSLSPVNSSN		HGPVSTGSLT		NRSPIEFPDT		ADFLNKPSVI
LQRSLGNAPN		TPDFYQQLRN		SDSNLCNSCG		HQMLKYVSTS		ESDGTDCCSG
KSGEEENIFS		KESFKLMETQ		QEEETEKKDS		RKLFQEGDKW		LTEEAQSEQQ
TNIEQEVSLD		LILVEEYDSL		IEKMSNWNFP		IFELVEKMGE		KSGRILSQVM
YTLFQDTGLL		EIFKIPTQQF		MNYFRALENG		YRDIPYHNRI		HATDVLHAVW
YLTTRPVPGL		QQIHNGCGTG		NETDSDGRIN		HGRIAYISSK		SCSNPDESYG
CLSSNIPALE		LMALYVAAAM		HDYDHPGRTN		AFLVATNAPQ		AVLYNDRSVL
ENHHAASAWN		LYLSRPEYNF		LLHLDHVEFK		RFRFLVIEAI		LATDLKKHFD
FLAEFNAKAN		DVNSNGIEWS		NENDRLLVCQ		VCIKLADING		PAKVRDLHLK
WTEGIVNEFY		EQGDEEANLG		LPISPFMDRS		SPQLAKLQES		FITHIVGPLC
NSYDAAGLLP		GQWLEAEEDN		DTESGDDEDG		EELDTEDEEM		ENNLNPKPPR
RKSRRRIFCQ		LMHHLTENHK		IWKEIVEEEE		KCKADGNKLQ		VENSSLPQAD
EIQVIEEADE		EE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ангіогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у мембрані.

Література

• Murata T., Taira M., Manganiello V.C. (1996). Differential expression of cGMP-inhibited cyclic nucleotide phosphodiesterases in human hepatoma cell lines. FEBS Lett. 390: 29—33. PMID 8706823 DOI:10.1016/0014-5793(96)00410-3
• Loebbert R.W., Winterpacht A., Seipel B., Zabel B.U. (1996). Molecular cloning and chromosomal assignment of the human homologue of the rat cGMP-inhibited phosphodiesterase 1 (PDE3A) -- a gene involved in fat metabolism located at 11p15.1. Genomics. 37: 211—218. PMID 8921398 DOI:10.1006/geno.1996.0544
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11