PDE4A

PDE4A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2QYK, 3I8V, 3TVX
Ідентифікатори
Символи	PDE4A, DPDE2, PDE4, PDE46, phosphodiesterase 4A
Зовнішні ІД	OMIM: 600126 MGI: 99558 HomoloGene: 4520 GeneCards: PDE4A
Реагує на сполуку
ібуділаст, Роліпрам, YM976, dyphylline, crisaborole, ібуділаст, tetomilast, flavoxate hydrochloride
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphoric diester hydrolase activity • cAMP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity • зв'язування з іоном металу • 3',5'-cyclic-AMP phosphodiesterase activity Клітинна компонента • цитоплазма • ruffle membrane • perinuclear region of cytoplasm • гіалоплазма • cell projection • мембрана • нуклеоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • sensory perception of smell • regulation of cAMP-mediated signaling • cAMP catabolic process • regulation of protein kinase A signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція • G protein-coupled receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5141	18577
Ensembl	ENSG00000065989	ENSMUSG00000032177
UniProt	P27815	O89084
RefSeq (мРНК)	NM_001111307 NM_001111308 NM_001111309 NM_001243121 NM_006202	NM_019798 NM_183408 NM_001310750
RefSeq (білок)	NP_001104777 NP_001104778 NP_001104779 NP_001230050 NP_006193	NP_001297679 NP_062772 NP_899668
Локус (UCSC)	Хр. 19: 10.42 – 10.47 Mb	Хр. 9: 21.08 – 21.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDE4A (англ. Phosphodiesterase 4A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 886 амінокислот, а молекулярна маса — 98 143.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPPTVPSER		SLSLSLPGPR		EGQATLKPPP		QHLWRQPRTP		IRIQQRGYSD
SAERAERERQ		PHRPIERADA		MDTSDRPGLR		TTRMSWPSSF		HGTGTGSGGA
GGGSSRRFEA		ENGPTPSPGR		SPLDSQASPG		LVLHAGAATS		QRRESFLYRS
DSDYDMSPKT		MSRNSSVTSE		AHAEDLIVTP		FAQVLASLRS		VRSNFSLLTN
VPVPSNKRSP		LGGPTPVCKA		TLSEETCQQL		ARETLEELDW		CLEQLETMQT
YRSVSEMASH		KFKRMLNREL		THLSEMSRSG		NQVSEYISTT		FLDKQNEVEI
PSPTMKEREK		QQAPRPRPSQ		PPPPPVPHLQ		PMSQITGLKK		LMHSNSLNNS
NIPRFGVKTD		QEELLAQELE		NLNKWGLNIF		CVSDYAGGRS		LTCIMYMIFQ
ERDLLKKFRI		PVDTMVTYML		TLEDHYHADV		AYHNSLHAAD		VLQSTHVLLA
TPALDAVFTD		LEILAALFAA		AIHDVDHPGV		SNQFLINTNS		ELALMYNDES
VLENHHLAVG		FKLLQEDNCD		IFQNLSKRQR		QSLRKMVIDM		VLATDMSKHM
TLLADLKTMV		ETKKVTSSGV		LLLDNYSDRI		QVLRNMVHCA		DLSNPTKPLE
LYRQWTDRIM		AEFFQQGDRE		RERGMEISPM		CDKHTASVEK		SQVGFIDYIV
HPLWETWADL		VHPDAQEILD		TLEDNRDWYY		SAIRQSPSPP		PEEESRGPGH
PPLPDKFQFE		LTLEEEEEEE		ISMAQIPCTA		QEALTAQGLS		GVEEALDATI
AWEASPAQES		LEVMAQEASL		EAELEAVYLT		QQAQSTGSAP		VAPDEFSSRE
EFVVAVSHSS		PSALALQSPL		LPAWRTLSVS		EHAPGLPGLP		STAAEVEAQR
EHQAAKRACS		ACAGTFGEDT		SALPAPGGGG		SGGDPT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.

Література

• Sullivan M., Egerton M., Shakur Y., Marquardsen A., Houslay M.D. (1994). Molecular cloning and expression, in both COS-1 cells and S. cerevisiae, of a human cytosolic type-IVA, cyclic AMP specific phosphodiesterase (hPDE-IVA-h6.1). Cell. Signal. 6: 793—812. PMID 7888306 DOI:10.1016/0898-6568(94)00039-5
• Horton Y.M., Sullivan M., Houslay M.D. (1995). Molecular cloning of a novel splice variant of human type IVA (PDE-IVA) cyclic AMP phosphodiesterase and localization of the gene to the p13.2-q12 region of human chromosome 19. Biochem. J. 308: 683—691. PMID 7772058 DOI:10.1042/bj3080683
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Див. також

• Хромосома 19