PDLIM3

PDLIM3
Ідентифікатори
Символи	PDLIM3, ALP, PDZ and LIM domain 3
Зовнішні ІД	OMIM: 605889 HomoloGene: 8710 GeneCards: PDLIM3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • structural constituent of muscle • actin binding • muscle alpha-actinin binding Клітинна компонента • Z disc • цитоплазма • actin cytoskeleton • stress fiber • filamentous actin Біологічний процес • heart development • actin filament organization • actin cytoskeleton organization • muscle structure development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27295	114108
Ensembl	ENSG00000154553	ENSRNOG00000012658
UniProt	Q53GG5	Q66HS7
RefSeq (мРНК)	NM_001114107 NM_001257962 NM_001257963 NM_014476	NM_053650
RefSeq (білок)	NP_001107579 NP_001244891 NP_001244892 NP_055291	NP_446102
Локус (UCSC)	Хр. 4: 185.5 – 185.54 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDLIM3 (англ. PDZ and LIM domain 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 364 амінокислот, а молекулярна маса — 39 232.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPQTVILPGP		APWGFRLSGG		IDFNQPLVIT		RITPGSKAAA		ANLCPGDVIL
AIDGFGTESM		THADAQDRIK		AAAHQLCLKI		DRGETHLWSP		QVSEDGKAHP
FKINLESEPQ		DGNYFEHKHN		IRPKPFVIPG		RSSGCSTPSG		IDCGSGRSTP
SSVSTVSTIC		PGDLKVAAKL		APNIPLEMEL		PGVKIVHAQF		NTPMQLYSDD
NIMETLQGQV		STALGETPLM		SEPTASVPPE		SDVYRMLHDN		RNEPTQPRQS
GSFRVLQGMV		DDGSDDRPAG		TRSVRAPVTK		VHGGSGGAQR		MPLCDKCGSG
IVGAVVKARD		KYRHPECFVC		ADCNLNLKQK		GYFFIEGELY		CETHARARTK
PPEGYDTVTL		YPKA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Xia H., Winokur S.T., Kuo W.-L., Altherr M.R., Bredt D.S. (1997). Actinin-associated LIM protein: identification of a domain interaction between PDZ and spectrin-like repeat motifs. J. Cell Biol. 139: 507—515. PMID 9334352 DOI:10.1083/jcb.139.2.507
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4