PDLIM4

PDLIM4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EEG, 2V1W, 4Q2O
Ідентифікатори
Символи	PDLIM4, RIL, PDZ and LIM domain 4
Зовнішні ІД	OMIM: 603422 MGI: 1353470 HomoloGene: 2735 GeneCards: PDLIM4
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein phosphatase binding • protein homodimerization activity • alpha-actinin binding • actin binding • muscle alpha-actinin binding Клітинна компонента • stress fiber • early endosome lumen • filamentous actin • recycling endosome lumen • postsynaptic membrane • клітинне ядро • цитоплазма • ендосома • цитоскелет • мембрана • lamellipodium • міжклітинні контакти • early endosome membrane • cell projection • neuron projection • dendritic spine • синапс • perinuclear region of cytoplasm • recycling endosome membrane • Z discdkac Біологічний процес • actin cytoskeleton reorganization • excitatory chemical synaptic transmission • heart development • actin cytoskeleton organization • muscle structure development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8572	30794
Ensembl	ENSG00000131435	ENSMUSG00000020388
UniProt	P50479	P70271
RefSeq (мРНК)	NM_003687 NM_001131027	NM_019417
RefSeq (білок)	NP_001124499 NP_003678	NP_062290
Локус (UCSC)	Хр. 5: 132.26 – 132.27 Mb	Хр. 11: 53.95 – 53.96 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDLIM4 (англ. PDZ and LIM domain 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 330 амінокислот, а молекулярна маса — 35 398.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPHSVTLRGP		SPWGFRLVGG		RDFSAPLTIS		RVHAGSKAAL		AALCPGDLIQ
AINGESTELM		THLEAQNRIK		GCHDHLTLSV		SRPEGRSWPS		APDDSKAQAH
RIHIDPEIQD		GSPTTSRRPS		GTGTGPEDGR		PSLGSPYGQP		PRFPVPHNGS
SEATLPAQMS		TLHVSPPPSA		DPARGLPRSR		DCRVDLGSEV		YRMLREPAEP
VAAEPKQSGS		FRYLQGMLEA		GEGGDWPGPG		GPRNLKPTAS		KLGAPLSGLQ
GLPECTRCGH		GIVGTIVKAR		DKLYHPECFM		CSDCGLNLKQ		RGYFFLDERL
YCESHAKARV		KPPEGYDVVA		VYPNAKVELV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5