PDZD11

PDZD11
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WI2
Ідентифікатори
Символи	PDZD11, AIPP1, PDZK11, PISP, PDZ domain containing 11
Зовнішні ІД	OMIM: 300632 MGI: 1919871 HomoloGene: 9530 GeneCards: PDZD11
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • extracellular region • гіалоплазма • синапс • cell-cell junction • presynapse • basolateral plasma membrane Біологічний процес • maintenance of epithelial cell apical/basal polarity • protein localization to basolateral plasma membrane • GO:0010554 neurotransmitter secretion • biotin metabolic process • pantothenate metabolic process • antimicrobial humoral response • ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51248	72621
Ensembl	ENSG00000120509	ENSMUSG00000015668
UniProt	Q5EBL8	Q9CZG9
RefSeq (мРНК)	NM_016484	NM_028303 NM_001356384
RefSeq (білок)	NP_057568 NP_001357103 NP_001357104 NP_001357105 NP_001357106 NP_001357107	NP_082579 NP_001343313
Локус (UCSC)	Хр. X: 70.29 – 70.29 Mb	Хр. X: 99.67 – 99.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDZD11 (англ. PDZ domain containing 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 140 амінокислот, а молекулярна маса — 16 131.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSRIPYDDY		PVVFLPAYEN		PPAWIPPHER		VHHPDYNNEL		TQFLPRTITL
KKPPGAQLGF		NIRGGKASQL		GIFISKVIPD		SDAHRAGLQE		GDQVLAVNDV
DFQDIEHSKA		VEILKTAREI		SMRVRFFPYN		YHRQKERTVH

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Goellner G.M., DeMarco S.J., Strehler E.E. (2003). Characterization of PISP, a novel single-PDZ protein that binds to all plasma membrane Ca2+-ATPase b-splice variants. Ann. N. Y. Acad. Sci. 986: 461—471. PMID 12763866 DOI:10.1111/j.1749-6632.2003.tb07230.x
• Stephenson S.E., Dubach D., Lim C.M., Mercer J.F., La Fontaine S. (2005). A single PDZ domain protein interacts with the Menkes copper ATPase, ATP7A. A new protein implicated in copper homeostasis. J. Biol. Chem. 280: 33270—33279. PMID 16051599 DOI:10.1074/jbc.M505889200

Див. також

• Хромосома X