PDZK1

PDZK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EEI, 2EEJ, 2VSP, 3TMH, 4Q2P
Ідентифікатори
Символи	PDZK1, CAP70, CLAMP, NHERF-3, NHERF3, PDZD1, PDZ domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603831 MGI: 1928901 HomoloGene: 1964 GeneCards: PDZK1
Онтологія гена Молекулярна функція • scavenger receptor binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • PDZ domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transporter activity Клітинна компонента • membrane raft • brush border membrane • клітинна мембрана • екзосома • apical plasma membrane • мембрана • microvillus membrane Біологічний процес • проліферація • carnitine transport • positive regulation of ion transmembrane transport • regulation of anion transport • positive regulation of protein targeting to membrane • GO:0015915 транспорт • positive regulation of ion transmembrane transporter activity • positive regulation of cation transmembrane transport • xenobiotic detoxification by transmembrane export across the plasma membrane Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5174	59020
Ensembl	ENSG00000174827	ENSMUSG00000038298
UniProt	Q5T2W1	Q9JIL4
RefSeq (мРНК)	NM_001201325 NM_001201326 NM_002614	NM_001146001 NM_021517 NM_001355710
RefSeq (білок)	NP_001188254 NP_001188255 NP_002605 NP_001358288 NP_001358290	NP_001139473 NP_067492 NP_001342639
Локус (UCSC)	Хр. 1: 145.67 – 145.71 Mb	Хр. 3: 96.74 – 96.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDZK1 (англ. PDZ domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 519 амінокислот, а молекулярна маса — 57 129.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSTFNPREC		KLSKQEGQNY		GFFLRIEKDT		EGHLVRVVEK		CSPAEKAGLQ
DGDRVLRING		VFVDKEEHMQ		VVDLVRKSGN		SVTLLVLDGD		SYEKAVKTRV
DLKELGQSQK		EQGLSDNILS		PVMNGGVQTW		TQPRLCYLVK		EGGSYGFSLK
TVQGKKGVYM		TDITPQGVAM		RAGVLADDHL		IEVNGENVED		ASHEEVVEKV
KKSGSRVMFL		LVDKETDKRH		VEQKIQFKRE		TASLKLLPHQ		PRIVEMKKGS
NGYGFYLRAG		SEQKGQIIKD		IDSGSPAEEA		GLKNNDLVVA		VNGESVETLD
HDSVVEMIRK		GGDQTSLLVV		DKETDNMYRL		AHFSPFLYYQ		SQELPNGSVK
EAPAPTPTSL		EVSSPPDTTE		EVDHKPKLCR		LAKGENGYGF		HLNAIRGLPG
SFIKEVQKGG		PADLAGLEDE		DVIIEVNGVN		VLDEPYEKVV		DRIQSSGKNV
TLLVCGKKAY		DYFQAKKIPI		VSSLADPLDT		PPDSKEGIVV		ESNHDSHMAK
ERAHSTASHS		SSNSEDTEM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wang S., Yue H., Derin R.B., Guggino W.B., Li M. (2000). Accessory protein facilitated CFTR-CFTR interaction, a molecular mechanism to potentiate the chloride channel activity. Cell. 103: 169—179. PMID 11051556 DOI:10.1016/S0092-8674(00)00096-9
• Kocher O., Comella N., Tognazzi K., Brown L.F. (1998). Identification and partial characterization of PDZK1: a novel protein containing PDZ interaction domains. Lab. Invest. 78: 117—125. PMID 9461128

Див. також

• Хромосома 1