PDZRN4

PDZRN4
Ідентифікатори
Символи	PDZRN4, LNX4, SAMCAP3L, PDZ domain containing ring finger 4
Зовнішні ІД	OMIM: 609730 MGI: 3056996 HomoloGene: 85433 GeneCards: PDZRN4
Пов'язані генетичні захворювання
розсіяний склероз
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29951	239618
Ensembl	ENSG00000165966	ENSMUSG00000036218
UniProt	Q6ZMN7	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001164595 NM_013377	NM_001164593 NM_001164594
RefSeq (білок)	NP_001158067 NP_037509	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 12: 41.19 – 41.57 Mb	Хр. 15: 92.29 – 92.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDZRN4 (англ. PDZ domain containing ring finger 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 036 амінокислот, а молекулярна маса — 117 103.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGFALERFAE		AVDPALECKL		CGQVLEEPLC		TPCGHVFCAS		CLLPWAVRRR
RCPLQCQPLA		PGELYRVLPL		RSLIQKLRVQ		CDYRARGCGH		SVRLHELEAH
VEHCDFGPAR		RLRSRGGCAS		GLGGGEVPAR		GGCGPTPRAG		RGGGARGGPP
GGRWGRGRGP		GPRVLAWRRR		EKALLAQLWA		LQGEVQLTAR		RYQEKFTQYM
AHVRNFVGDL		GGGHRRDGEH		KPFTIVLERE		NDTLGFNIIG		GRPNQNNQEG
TSTEGIYVSK		ILENGPADRA		DGLEIHDKIM		EVNGKDLSKA		THEEAVEAFR
NAKEPIVVQV		LRRTPLSRPA		YGMASEVQLM		NASTQTDITF		EHIMALAKLR
PPTPPVPDIC		PFLLSDSCHS		LHPMEHEFYE		DNEYISSLPA		DADRTEDFEY
EEVELCRVSS		QEKLGLTVCY		RTDDEEDTGI		YVSEVDPNSI		AAKDGRIREG
DRILQINGED		VQNREEAVAL		LSNDECKRIV		LLVARPEIQL		DEGWLEDERN
EFLEELNLEM		LEEEHNEAMQ		PTANEVEQPK		KQEEEEGTTD		TATSSSNNHE
KDSGVGRTDE		SLRNDESSEQ		ENAAEDPNST		SLKSKRDLGQ		SQDTLGSVEL
QYNESLVSGE		YIDSDCIGNP		DEDCERFRQL		LELKCKIRNH		GEYDLYYSSS
TIECNQGEQE		GVEHELQLLN		EELRNIELEC		QNIMQAHRLQ		KVTDQYGDIW
TLHDGGFRNY		NTSIDMQRGK		LDDIMEHPEK		SDKDSSSAYN		TAESCRSTPL
TVDRSPDSSL		PRVINLTNKK		NLRSTMAATQ		SSSGQSSKES		TSTKAKTTEQ
GCSAESKEKV		LEGSKLPDQE		KAVSEHIPYL		SPYHSSSYRY		ANIPAHARHY
QSYMQLIQQK		SAVEYAQSQL		SLVSMCKESQ		KCSEPKMEWK		VKIRSDGTRY
ITKRPVRDRI		LKERALKIKE		ERSGMTTDDD		TMSEMKMGRY		WSKEERKQHL
VRAKEQRRRR		EFMMRSRLEC		LKESPQSGSE		GKKEINIIEL		SHKKMMKKRN
KKILDNWMTI		QELMTHGAKS		PDGTRVHNAF		LSVTTV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Katoh M., Katoh M. (2004). Identification and characterization of PDZRN3 and PDZRN4 genes in silico. Int. J. Mol. Med. 13: 607—613. PMID 15010864

Див. також

• Хромосома 12