PGAM5

PGAM5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3MXO, 3O0T
Ідентифікатори
Символи	PGAM5, BXLBV68, PGAM family member 5, mitochondrial serine/threonine protein phosphatase
Зовнішні ІД	OMIM: 614939 MGI: 1919792 HomoloGene: 14597 GeneCards: PGAM5
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • phosphoprotein phosphatase activity • hydrolase activity • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • protein serine/threonine phosphatase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • мітохондрія • мітохондріальна зовнішня мембрана Біологічний процес • GO:0016576 protein dephosphorylation • GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз • GO:0010703, GO:0010702 запрограмована клітинна смерть • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • macroautophagy • negative regulation of cold-induced thermogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	192111	72542
Ensembl	ENSG00000247077	ENSMUSG00000029500
UniProt	Q96HS1	Q8BX10
RefSeq (мРНК)	NM_138575 NM_001170543 NM_001170544	NM_001163538 NM_028273
RefSeq (білок)	NP_001164014 NP_001164015 NP_612642	NP_001157010 NP_082549
Локус (UCSC)	Хр. 12: 132.71 – 132.72 Mb	Хр. 5: 110.41 – 110.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PGAM5 (англ. PGAM family member 5, mitochondrial serine/threonine protein phosphatase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 289 амінокислот, а молекулярна маса — 32 004.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAFRQALQLA		ACGLAGGSAA		VLFSAVAVGK		PRAGGDAEPR		PAEPPAWAGG
ARPGPGVWDP		NWDRREPLSL		INVRKRNVES		GEEELASKLD		HYKAKATRHI
FLIRHSQYHV		DGSLEKDRTL		TPLGREQAEL		TGLRLASLGL		KFNKIVHSSM
TRAIETTDII		SRHLPGVCKV		STDLLREGAP		IEPDPPVSHW		KPEAVQYYED
GARIEAAFRN		YIHRADARQE		EDSYEIFICH		ANVIRYIVCR		ALQFPPEGWL
RLSLNNGSIT		HLVIRPNGRV		ALRTLGDTGF		MPPDKITRS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, мітохондрії, зовнішній мембрані мітохондрій.

Література

• Lo S.-C., Hannink M. (2006). PGAM5, a Bcl-XL-interacting protein, is a novel substrate for the redox-regulated Keap1-dependent ubiquitin ligase complex. J. Biol. Chem. 281: 37893—37903. PMID 17046835 DOI:10.1074/jbc.M606539200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hammond P.W., Alpin J., Rise C.E., Wright M., Kreider B.L. (2001). In vitro selection and characterization of Bcl-X(L)-binding proteins from a mix of tissue-specific mRNA display libraries. J. Biol. Chem. 276: 20898—20906. PMID 11283018 DOI:10.1074/jbc.M011641200
• Lo S.-C., Hannink M. (2008). PGAM5 tethers a ternary complex containing Keap1 and Nrf2 to mitochondria. Exp. Cell Res. 314: 1789—1803. PMID 18387606 DOI:10.1016/j.yexcr.2008.02.014
• Wang Z., Jiang H., Chen S., Du F., Wang X. (2012). The mitochondrial phosphatase PGAM5 functions at the convergence point of multiple necrotic death pathways. Cell. 148: 228—243. PMID 22265414 DOI:10.1016/j.cell.2011.11.030

Див. також

• Хромосома 12