PHC3

PHC3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4PZN, 4PZO
Ідентифікатори
Символи	PHC3, EDR3, HPH3, polyhomeotic homolog 3
Зовнішні ІД	MGI: 2181434 HomoloGene: 69390 GeneCards: PHC3
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • PcG protein complex • PRC1 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • multicellular organism development • negative regulation of G0 to G1 transition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80012	241915
Ensembl	ENSG00000173889	ENSMUSG00000037652
UniProt	Q8NDX5	Q8CHP6
RefSeq (мРНК)	NM_001308116 NM_024947	NM_001165954 NM_001165955 NM_001165956 NM_153421
RefSeq (білок)	NP_001295045 NP_079223	NP_001159426 NP_001159427 NP_001159428 NP_700470
Локус (UCSC)	Хр. 3: 170.09 – 170.18 Mb	Хр. 3: 30.95 – 31.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PHC3 (англ. Polyhomeotic homolog 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 983 амінокислот, а молекулярна маса — 106 162.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDTEPNPGTS		SVSTTTSSTT		TTTITTSSSR		MQQPQISVYS		GSDRHAVQVI
QQALHRPPSS		AAQYLQQMYA		AQQQHLMLHT		AALQQQHLSS		SQLQSLAAVQ
ASLSSGRPST		SPTGSVTQQS		SMSQTSINLS		TSPTPAQLIS		RSQASSSTSG
SITQQTMLLG		STSPTLTASQ		AQMYLRAQML		IFTPATTVAA		VQSDIPVVSS
SSSSSCQSAA		TQVQNLTLRS		QKLGVLSSSQ		NGPPKSTSQT		QSLTICHNKT
TVTSSKISQR		DPSPESNKKG		ESPSLESRST		AVTRTSSIHQ		LIAPASYSPI
QPHSLIKHQQ		IPLHSPPSKV		SHHQLILQQQ		QQQIQPITLQ		NSTQDPPPSQ
HCIPLQNHGL		PPAPSNAQSQ		HCSPIQSHPS		PLTVSPNQSQ		SAQQSVVVSP
PPPHSPSQSP		TIIIHPQALI		QPHPLVSSAL		QPGPNLQQST		ANQVQATAQL
NLPSHLPLPA		SPVVHIGPVQ		QSALVSPGQQ		IVSPSHQQYS		SLQSSPIPIA
SPPQMSTSPP		AQIPPLPLQS		MQSLQVQPEI		LSQGQVLVQN		ALVSEEELPA
AEALVQLPFQ		TLPPPQTVAV		NLQVQPPAPV		DPPVVYQVED		VCEEEMPEES
DECVRMDRTP		PPPTLSPAAI		TVGRGEDLTS		EHPLLEQVEL		PAVASVSASV
IKSPSDPSHV		SVPPPPLLLP		AATTRSNSTS		MHSSIPSIEN		KPPQAIVKPQ
ILTHVIEGFV		IQEGLEPFPV		SRSSLLIEQP		VKKRPLLDNQ		VINSVCVQPE
LQNNTKHADN		SSDTEMEDMI		AEETLEEMDS		ELLKCEFCGK		MGYANEFLRS
KRFCTMSCAK		RYNVSCSKKF		ALSRWNRKPD		NQSLGHRGRR		PSGPDGAARE
HILRQLPITY		PSAEEDLASH		EDSVPSAMTT		RLRRQSERER		ERELRDVRIR
KMPENSDLLP		VAQTEPSIWT		VDDVWAFIHS		LPGCQDIADE		FRAQEIDGQA
LLLLKEDHLM		SAMNIKLGPA		LKICARINSL		KES

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Tonkin E., Hagan D.-M., Li W., Strachan T. (2002). Identification and characterisation of novel mammalian homologues of Drosophila polyhomeotic permits new insights into relationships between members of the polyhomeotic family. Hum. Genet. 111: 435—442. PMID 12384788 DOI:10.1007/s00439-002-0814-3
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Vandamme J., Volkel P., Rosnoblet C., Le Faou P., Angrand P.O. (2011). Interaction proteomics analysis of polycomb proteins defines distinct PRC1 Complexes in mammalian cells. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 21282530 DOI:10.1074/mcp.M110.002642

Див. також

• Хромосома 3