PITPNM1

PITPNM1
Ідентифікатори
Символи	PITPNM1, DRES9, NIR2, PITPNM, RDGB, RDGB1, RDGBA, RDGBA1, Rd9, phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608794 MGI: 1197524 HomoloGene: 3608 GeneCards: PITPNM1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • phosphatidylinositol transfer activity • phosphatidylcholine binding • phosphatidylinositol binding • phosphatidic acid binding • phospholipid transporter activity • calcium ion binding • receptor tyrosine kinase binding • phosphatidylcholine transporter activity Клітинна компонента • Golgi cisterna membrane • lipid droplet • комплекс Ґольджі • midbody • Борозна розщеплення • внутрішньоклітинний • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • цитоплазма • гіалоплазма • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • центр організації мікротрубочок • cell body Біологічний процес • protein transport • brain development • lipid metabolism • phototransduction • phosphatidylinositol biosynthetic process • phospholipid transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9600	18739
Ensembl	ENSG00000110697	ENSMUSG00000024851
UniProt	O00562	O35954
RefSeq (мРНК)	NM_001130848 NM_004910	NM_001136078 NM_008851
RefSeq (білок)	NP_001124320 NP_004901	NP_032877
Локус (UCSC)	Хр. 11: 67.49 – 67.51 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PITPNM1 (англ. Phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 244 амінокислот, а молекулярна маса — 134 848.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLIKEYHILL		PMSLDEYQVA		QLYMIQKKSR		EESSGEGSGV		EILANRPYTD
GPGGSGQYTH		KVYHVGSHIP		GWFRALLPKA		ALQVEEESWN		AYPYTRTRYT
CPFVEKFSIE		IETYYLPDGG		QQPNVFNLSG		AERRQRILDT		IDIVRDAVAP
GEYKAEEDPR		LYHSVKTGRG		PLSDDWARTA		AQTGPLMCAY		KLCKVEFRYW
GMQAKIEQFI		HDVGLRRVML		RAHRQAWCWQ		DEWTELSMAD		IRALEEETAR
MLAQRMAKCN		TGSEGSEAQP		PGKPSTEARS		AASNTGTPDG		PEAPPGPDAS
PDASFGKQWS		SSSRSSYSSQ		HGGAVSPQSL		SEWRMQNIAR		DSENSSEEEF
FDAHEGFSDS		EEVFPKEMTK		WNSNDFIDAF		ASPVEAEGTP		EPGAEAAKGI
EDGAQAPRDS		EGLDGAGELG		AEACAVHALF		LILHSGNILD		SGPGDANSKQ
ADVQTLSSAF		EAVTRIHFPE		ALGHVALRLV		PCPPICAAAY		ALVSNLSPYS
HDGDSLSRSQ		DHIPLAALPL		LATSSSRYQG		AVATVIARTN		QAYSAFLRSP
EGAGFCGQVA		LIGDGVGGIL		GFDALCHSAN		AGTGSRGSSR		RGSMNNELLS
PEFGPVRDPL		ADGVEGLGRG		SPEPSALPPQ		RIPSDMASPE		PEGSQNSLQA
APATTSSWEP		RRASTAFCPP		AASSEAPDGP		SSTARLDFKV		SGFFLFGSPL
GLVLALRKTV		MPALEAAQMR		PACEQIYNLF		HAADPCASRL		EPLLAPKFQA
IAPLTVPRYQ		KFPLGDGSSL		LLADTLQTHS		SLFLEELEML		VPSTPTSTSG
AFWKGSELAT		DPPAQPAAPS		TTSEVVKILE		RWWGTKRIDY		SLYCPEALTA
FPTVTLPHLF		HASYWESADV		VAFILRQVIE		KERPQLAECE		EPSIYSPAFP
REKWQRKRTQ		VKIRNVTSNH		RASDTVVCEG		RPQVLSGRFM		YGPLDVVTLT
GEKVDVYIMT		QPLSGKWIHF		GTEVTNSSGR		LTFPVPPERA		LGIGVYPVRM
VVRGDHTYAE		CCLTVVARGT		EAVVFSIDGS		FTASVSIMGS		DPKVRAGAVD
VVRHWQDSGY		LIVYVTGRPD		MQKHRVVAWL		SQHNFPHGVV		SFCDGLTHDP
LRQKAMFLQS		LVQEVELNIV		AGYGSPKDVA		VYAALGLSPS		QTYIVGRAVR
KLQAQCQFLS		DGYVAHLGQL		EAGSHSHASS		GPPRAALGKS		SYGVAAPVDF
LRKQSQLLRS		RGPSQAEREG		PGTPPTTLAR		GKARSISLKL		DSEE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, ліпідних краплях, апараті гольджі.

Література

• Ocaka L., Spalluto C., Wilson D.I., Hunt D.M., Halford S. (2005). Chromosomal localization, genomic organization and evolution of the genes encoding human phosphatidylinositol transfer protein membrane-associated (PITPNM) 1, 2 and 3. Cytogenet. Genome Res. 108: 293—302. PMID 15627748 DOI:10.1159/000081519
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tian D., Litvak V., Toledo-Rodriguez M., Carmon S., Lev S. (2002). Nir2, a novel regulator of cell morphogenesis. Mol. Cell. Biol. 22: 2650—2662. PMID 11909959 DOI:10.1128/MCB.22.8.2650-2662.2002
• Amarilio R., Ramachandran S., Sabanay H., Lev S. (2005). Differential regulation of endoplasmic reticulum structure through VAP-Nir protein interaction. J. Biol. Chem. 280: 5934—5944. PMID 15545272 DOI:10.1074/jbc.M409566200
• Litvak V., Dahan N., Ramachandran S., Sabanay H., Lev S. (2005). Maintenance of the diacylglycerol level in the Golgi apparatus by the Nir2 protein is critical for Golgi secretory function. Nat. Cell Biol. 7: 225—234. PMID 15723057 DOI:10.1038/ncb1221

Див. також

• Хромосома 11