PITRM1

PITRM1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4L3T, 4NGE, 4RPU
Ідентифікатори
Символи	PITRM1, MP1, PreP, pitrilysin metallopeptidase 1, SCAR30
Зовнішні ІД	OMIM: 618211 MGI: 1916867 HomoloGene: 5742 GeneCards: PITRM1
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • GO:0010577 enzyme activator activity • каталітична активність • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • metallopeptidase activity • metalloendopeptidase activity • zinc ion binding Клітинна компонента • мітохондрія • мітохондріальний матрикс Біологічний процес • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • protein targeting to mitochondrion • протеоліз • protein processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10531	69617
Ensembl	ENSG00000107959	ENSMUSG00000021193
UniProt	Q5JRX3	Q8K411
RefSeq (мРНК)	NM_001242307 NM_001242309 NM_014889 NM_014968 NM_001347725 NM_001347726 NM_001347727 NM_001347728 NM_001347729 NM_001347730	NM_145131 NM_001360106
RefSeq (білок)	NP_001229236 NP_001229238 NP_001334654 NP_001334655 NP_001334656 NP_001334657 NP_001334658 NP_001334659 NP_055704	NP_660113 NP_001347035
Локус (UCSC)	Хр. 10: 3.14 – 3.17 Mb	Хр. 13: 6.6 – 6.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PITRM1 (англ. Pitrilysin metallopeptidase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 037 амінокислот, а молекулярна маса — 117 413.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWRCGGRQGL		CVLRRLSGGH		AHHRAWRWNS		NRACERALQY		KLGDKIHGFT
VNQVTSVPEL		FLTAVKLTHD		DTGARYLHLA		REDTNNLFSV		QFRTTPMDST
GVPHILEHTV		LCGSQKYPCR		DPFFKMLNRS		LSTFMNAFTA		SDYTLYPFST
QNPKDFQNLL		SVYLDATFFP		CLRELDFWQE		GWRLEHENPS		DPQTPLVFKG
VVFNEMKGAF		TDNERIFSQH		LQNRLLPDHT		YSVVSGGDPL		CIPELTWEQL
KQFHATHYHP		SNARFFTYGN		FPLEQHLKQI		HEEALSKFQK		IEPSTVVPAQ
TPWDKPREFQ		ITCGPDSFAT		DPSKQTTISV		SFLLPDITDT		FEAFTLSLLS
SLLTSGPNSP		FYKALIESGL		GTDFSPDVGY		NGYTREAYFS		VGLQGIAEKD
IETVRSLIDR		TIDEVVEKGF		EDDRIEALLH		KIEIQMKHQS		TSFGLMLTSY
IASCWNHDGD		PVELLKLGNQ		LAKFRQCLQE		NPKFLQEKVK		QYFKNNQHKL
TLSMRPDDKY		HEKQAQVEAT		KLKQKVEALS		PGDRQQIYEK		GLELRSQQSK
PQDASCLPAL		KVSDIEPTIP		VTELDVVLTA		GDIPVQYCAQ		PTNGMVYFRA
FSSLNTLPEE		LRPYVPLFCS		VLTKLGCGLL		DYREQAQQIE		LKTGGMSASP
HVLPDDSHMD		TYEQGVLFSS		LCLDRNLPDM		MQLWSEIFNN		PCFEEEEHFK
VLVKMTAQEL		ANGIPDSGHL		YASIRAGRTL		TPAGDLQETF		SGMDQVRLMK
RIAEMTDIKP		ILRKLPRIKK		HLLNGDNMRC		SVNATPQQMP		QTEKAVEDFL
RSIGRSKKER		RPVRPHTVEK		PVPSSSGGDA		HVPHGSQVIR		KLVMEPTFKP
WQMKTHFLMP		FPVNYVGECI		RTVPYTDPDH		ASLKILARLM		TAKFLHTEIR
EKGGAYGGGA		KLSHNGIFTL		YSYRDPNTIE		TLQSFGKAVD		WAKSGKFTQQ
DIDEAKLSVF		STVDAPVAPS		DKGMDHFLYG		LSDEMKQAHR		EQLFAVSHDK
LLAVSDRYLG		TGKSTHGLAI		LGPENPKIAK		DPSWIIQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мітохондрії.

Література

• Mzhavia N., Berman Y.L., Qian Y., Yan L., Devi L.A. (1999). Cloning, expression, and characterization of human metalloprotease 1: a novel member of the pitrilysin family of metalloendoproteases. DNA Cell Biol. 18: 369—380. PMID 10360838 DOI:10.1089/104454999315268
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 10