PLOD2

PLOD2
Ідентифікатори
Символи	PLOD2, LH2, TLH, BRKS2, procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 601865 MGI: 1347007 HomoloGene: 22681 GeneCards: PLOD2
Онтологія гена Молекулярна функція • iron ion binding • L-ascorbic acid binding • oxidoreductase activity • dioxygenase activity • GO:0050602 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen • зв'язування з іоном металу • procollagen-lysine 5-dioxygenase activity • procollagen glucosyltransferase activity Клітинна компонента • rough endoplasmic reticulum membrane • екзосома • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • мембрана Біологічний процес • response to hypoxia • protein O-linked glycosylation • peptidyl-lysine hydroxylation • hydroxylysine biosynthetic process • collagen fibril organization • collagen metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5352	26432
Ensembl	ENSG00000152952	ENSMUSG00000032374
UniProt	O00469	Q9R0B9
RefSeq (мРНК)	NM_000935 NM_182943	NM_001142916 NM_011961
RefSeq (білок)	NP_000926 NP_891988	NP_001136388 NP_036091
Локус (UCSC)	Хр. 3: 146.07 – 146.16 Mb	Хр. 9: 92.42 – 92.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PLOD2 (англ. Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 737 амінокислот, а молекулярна маса — 84 686.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGGCTVKPQL		LLLALVLHPW		NPCLGADSEK		PSSIPTDKLL		VITVATKESD
GFHRFMQSAK		YFNYTVKVLG		QGEEWRGGDG		INSIGGGQKV		RLMKEVMEHY
ADQDDLVVMF		TECFDVIFAG		GPEEVLKKFQ		KANHKVVFAA		DGILWPDKRL
ADKYPVVHIG		KRYLNSGGFI		GYAPYVNRIV		QQWNLQDNDD		DQLFYTKVYI
DPLKREAINI		TLDHKCKIFQ		TLNGAVDEVV		LKFENGKARA		KNTFYETLPV
AINGNGPTKI		LLNYFGNYVP		NSWTQDNGCT		LCEFDTVDLS		AVDVHPNVSI
GVFIEQPTPF		LPRFLDILLT		LDYPKEALKL		FIHNKEVYHE		KDIKVFFDKA
KHEIKTIKIV		GPEENLSQAE		ARNMGMDFCR		QDEKCDYYFS		VDADVVLTNP
RTLKILIEQN		RKIIAPLVTR		HGKLWSNFWG		ALSPDGYYAR		SEDYVDIVQG
NRVGVWNVPY		MANVYLIKGK		TLRSEMNERN		YFVRDKLDPD		MALCRNAREM
GVFMYISNRH		EFGRLLSTAN		YNTSHYNNDL		WQIFENPVDW		KEKYINRDYS
KIFTENIVEQ		PCPDVFWFPI		FSEKACDELV		EEMEHYGKWS		GGKHHDSRIS
GGYENVPTDD		IHMKQVDLEN		VWLHFIREFI		APVTLKVFAG		YYTKGFALLN
FVVKYSPERQ		RSLRPHHDAS		TFTINIALNN		VGEDFQGGGC		KFLRYNCSIE
SPRKGWSFMH		PGRLTHLHEG		LPVKNGTRYI		AVSFIDP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Yeowell H.N., Walker L.C. (1999). Tissue specificity of a new splice form of the human lysyl hydroxylase 2 gene. Matrix Biol. 18: 179—187. PMID 10372558 DOI:10.1016/S0945-053X(99)00013-X
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3