PLXDC1

PLXDC1
Ідентифікатори
Символи	PLXDC1, TEM3, TEM7, plexin domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606826 MGI: 1919574 HomoloGene: 10700 GeneCards: PLXDC1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • extracellular region • міжклітинні контакти • neuronal cell body • receptor complex • клітинна мембрана • дендрит (нейробіологія) • внутрішньоклітинний • мембрана • bicellular tight junction • міжклітинний простір Біологічний процес • Ангіогенез • spinal cord development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57125	72324
Ensembl	ENSG00000161381	ENSMUSG00000017417
UniProt	Q8IUK5	Q91ZV7
RefSeq (мРНК)	NM_020405	NM_001163608 NM_028199
RefSeq (білок)	NP_065138	NP_001157080 NP_082475
Локус (UCSC)	Хр. 17: 39.06 – 39.15 Mb	Хр. 11: 97.81 – 97.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PLXDC1 (англ. Plexin domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 500 амінокислот, а молекулярна маса — 55 760.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRGELWLLVL		VLREAARALS		PQPGAGHDEG		PGSGWAAKGT		VRGWNRRARE
SPGHVSEPDR		TQLSQDLGGG		TLAMDTLPDN		RTRVVEDNHS		YYVSRLYGPS
EPHSRELWVD		VAEANRSQVK		IHTILSNTHR		QASRVVLSFD		FPFYGHPLRQ
ITIATGGFIF		MGDVIHRMLT		ATQYVAPLMA		NFNPGYSDNS		TVVYFDNGTV
FVVQWDHVYL		QGWEDKGSFT		FQAALHHDGR		IVFAYKEIPM		SVPEISSSQH
PVKTGLSDAF		MILNPSPDVP		ESRRRSIFEY		HRIELDPSKV		TSMSAVEFTP
LPTCLQHRSC		DACMSSDLTF		NCSWCHVLQR		CSSGFDRYRQ		EWMDYGCAQE
AEGRMCEDFQ		DEDHDSASPD		TSFSPYDGDL		TTTSSSLFID		SLTTEDDTKL
NPYAGGDGLQ		NNLSPKTKGT		PVHLGTIVGI		VLAVLLVAAI		ILAGIYINGH
PTSNAALFFI		ERRPHHWPAM		KFRSHPDHST		YAEVEPSGHE		KEGFMEAEQC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee H.K., Seo I.A., Park H.K., Park H.T. (2006). Identification of the basement membrane protein nidogen as a candidate ligand for tumor endothelial marker 7 in vitro and in vivo. FEBS Lett. 580: 2253—2257. PMID 16574105 DOI:10.1016/j.febslet.2006.03.033

Див. також

• Хромосома 17