PODXL2

PODXL2
Ідентифікатори
Символи	PODXL2, EG, PODLX2, podocalyxin like 2
Зовнішні ІД	OMIM: 616627 MGI: 2442488 HomoloGene: 9254 GeneCards: PODXL2
Онтологія гена Молекулярна функція • glycosaminoglycan binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • Golgi lumen Біологічний процес • leukocyte tethering or rolling • адгезія клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	50512	319655
Ensembl	ENSG00000114631	ENSMUSG00000033152
UniProt	Q9NZ53	Q8CAE9
RefSeq (мРНК)	NM_015720	NM_176973 NM_001347327 NM_001364575
RefSeq (білок)	NP_056535	NP_001334256 NP_795947 NP_001351504 NP_001366146 NP_001366147 NP_001366148 NP_001366149 NP_001366150 NP_001366151 NP_001366152
Локус (UCSC)	Хр. 3: 127.63 – 127.67 Mb	Хр. 6: 88.84 – 88.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PODXL2 (англ. Podocalyxin like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 605 амінокислот, а молекулярна маса — 65 076.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGRLLRAARL		PPLLSPLLLL		LVGGAFLGAC		VAGSDEPGPE		GLTSTSLLDL
LLPTGLEPLD		SEEPSETMGL		GAGLGAPGSG		FPSEENEESR		ILQPPQYFWE
EEEELNDSSL		DLGPTADYVF		PDLTEKAGSI		EDTSQAQELP		NLPSPLPKMN
LVEPPWHMPP		REEEEEEEEE		EEREKEEVEK		QEEEEEEELL		PVNGSQEEAK
PQVRDFSLTS		SSQTPGATKS		RHEDSGDQAS		SGVEVESSMG		PSLLLPSVTP
TTVTPGDQDS		TSQEAEATVL		PAAGLGVEFE		APQEASEEAT		AGAAGLSGQH
EEVPALPSFP		QTTAPSGAEH		PDEDPLGSRT		SASSPLAPGD		MELTPSSATL
GQEDLNQQLL		EGQAAEAQSR		IPWDSTQVIC		KDWSNLAGKN		YIILNMTENI
DCEVFRQHRG		PQLLALVEEV		LPRHGSGHHG		AWHISLSKPS		EKEQHLLMTL
VGEQGVVPTQ		DVLSMLGDIR		RSLEEIGIQN		YSTTSSCQAR		ASQVRSDYGT
LFVVLVVIGA		ICIIIIALGL		LYNCWQRRLP		KLKHVSHGEE		LRFVENGCHD
NPTLDVASDS		QSEMQEKHPS		LNGGGALNGP		GSWGALMGGK		RDPEDSDVFE
EDTHL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з сіаловими кислотами. Локалізований у мембрані.

Література

• Sassetti C., Van Zante A., Rosen S.D. (2000). Identification of endoglycan, a member of the CD34/podocalyxin family of sialomucins. J. Biol. Chem. 275: 9001—9010. PMID 10722749 DOI:10.1074/jbc.275.12.9001
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fieger C.B., Sassetti C.M., Rosen S.D. (2003). Endoglycan, a member of the CD34 family, functions as an L-selectin ligand through modification with tyrosine sulfation and sialyl Lewis x. J. Biol. Chem. 278: 27390—27398. PMID 12889478 DOI:10.1074/jbc.M304204200
• Kerr S.C., Fieger C.B., Snapp K.R., Rosen S.D. (2008). Endoglycan, a member of the CD34 family of sialomucins, is a ligand for the vascular selectins. J. Immunol. 181: 1480—1490. PMID 18606703 DOI:10.4049/jimmunol.181.2.1480
• Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h

Див. також

• Хромосома 3