POGK

POGK
Ідентифікатори
Символи	POGK, BASS2, KRBOX2, LST003, pogo transposable element with KRAB domain, pogo transposable element derived with KRAB domain
Зовнішні ІД	MGI: 1918842 HomoloGene: 32346 GeneCards: POGK
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • клітинне ядро Біологічний процес • multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57645	71592
Ensembl	ENSG00000143157	ENSMUSG00000040596
UniProt	Q9P215	Q80TC5
RefSeq (мРНК)	NM_001314014 NM_017542	NM_001142948 NM_175170
RefSeq (білок)	NP_001300943 NP_060012	NP_001136420 NP_780379 NP_001392091 NP_001392092 NP_001392093 NP_001392094
Локус (UCSC)	Хр. 1: 166.84 – 166.86 Mb	Хр. 1: 166.21 – 166.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

POGK (англ. Pogo transposable element derived with KRAB domain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 609 амінокислот, а молекулярна маса — 69 444.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESTAYPLNL		SLKEEEEEEE		IQSRELEDGP		ADMQKVRICS		EGGWVPALFD
EVAIYFSDEE		WEVLTEQQKA		LYREVMRMNY		ETVLSLEFPF		PKPDMITRLE
GEEESQNSDE		WQLQGGTSAE		NEESDVKPPD		WPNPMNATSQ		FPQPQHFDSF
GLRLPRDITE		LPEWSEGYPF		YMAMGFPGYD		LSADDIAGKF		QFSRGMRRSY
DAGFKLMVVE		YAESTNNCQA		AKQFGVLEKN		VRDWRKVKPQ		LQNAHAMRRA
FRGPKNGRFA		LVDQRVAEYV		RYMQAKGDPI		TREAMQLKAL		EIAQEMNIPE
KGFKASLGWC		RRMMRRYDLS		LRHKVPVPQH		LPEDLTEKLV		TYQRSVLALR
RAHDYEVAQM		GNADETPICL		EVPSRVTVDN		QGEKPVLVKT		PGREKLKITA
MLGVLADGRK		LPPYIILRGT		YIPPGKFPSG		MEIRCHRYGW		MTEDLMQDWL
EVVWRRRTGA		VPKQRGMLIL		NGFRGHATDS		VKNSMESMNT		DMVIIPGGLT
SQLQVLDVVV		YKPLNDSVRA		QYSNWLLAGN		LALSPTGNAK		KPPLGLFLEW
VMVAWNSISS		ESIVQGFKKC		HISSNLEEED		DVLWEIESEL		PGGGEPPKDC
DTESMAESN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1