PPFIA2

PPFIA2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3TAC, 3TAD
Ідентифікатори
Символи	PPFIA2, PTPRF interacting protein alpha 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603143 MGI: 2443834 HomoloGene: 27953 GeneCards: PPFIA2
Пов'язані генетичні захворювання
шизофренія
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • structural constituent of presynapse Клітинна компонента • цитоплазма • presynaptic active zone • cell surface • гіалоплазма • синапс • екзосома • glutamatergic synapse Біологічний процес • glutamate secretion • cell-matrix adhesion • GO:0010554 neurotransmitter secretion • presynapse organization • regulation of synaptic vesicle exocytosis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8499	327814
Ensembl	ENSG00000139220	ENSMUSG00000053825
UniProt	O75334	Q8BSS9
RefSeq (мРНК)	NM_001220473 NM_001220474 NM_001220475 NM_001220476 NM_001220477 NM_001220478 NM_001220479 NM_001220480 NM_001282536 NM_003625	NM_001205341 NM_177373 NM_001359672 NM_001359673 NM_001359674 NM_001359675 NM_001359676 NM_001359677 NM_001359678 NM_001359679 NM_001359680 NM_001359681 NM_001359682 NM_001359683 NM_001359684 NM_001359685 NM_001359686 NM_001359687 NM_001359688 NM_001359689 NM_001359690 NM_001359691 NM_001359692 NM_001359693 NM_001359694 NM_001359695 NM_001359696 NM_001359697 NM_001359698
RefSeq (білок)	NP_001207402 NP_001207403 NP_001207404 NP_001207405 NP_001207406 NP_001207407 NP_001207408 NP_001207409 NP_001269465 NP_003616	NP_001192270 NP_796347 NP_001346601 NP_001346602 NP_001346603 NP_001346604 NP_001346605 NP_001346606 NP_001346607 NP_001346608 NP_001346609 NP_001346610 NP_001346611 NP_001346612 NP_001346613 NP_001346614 NP_001346615 NP_001346616 NP_001346617 NP_001346618 NP_001346619 NP_001346620 NP_001346621 NP_001346622 NP_001346623 NP_001346624 NP_001346625 NP_001346626 NP_001346627
Локус (UCSC)	Хр. 12: 81.26 – 81.76 Mb	Хр. 10: 106.31 – 106.77 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PPFIA2 (англ. PTPRF interacting protein alpha 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 257 амінокислот, а молекулярна маса — 143 291.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMCEVMPTIN		EDTPMSQRGS		QSSGSDSDSH		FEQLMVNMLD		ERDRLLDTLR
ETQESLSLAQ		QRLQDVIYDR		DSLQRQLNSA		LPQDIESLTG		GLAGSKGADP
PEFAALTKEL		NACREQLLEK		EEEISELKAE		RNNTRLLLEH		LECLVSRHER
SLRMTVVKRQ		AQSPSGVSSE		VEVLKALKSL		FEHHKALDEK		VRERLRVSLE
RVSALEEELA		AANQEIVALR		EQNVHIQRKM		ASSEGSTESE		HLEGMEPGQK
VHEKRLSNGS		IDSTDETSQI		VELQELLEKQ		NYEMAQMKER		LAALSSRVGE
VEQEAETARK		DLIKTEEMNT		KYQRDIREAM		AQKEDMEERI		TTLEKRYLSA
QRESTSIHDM		NDKLENELAN		KEAILRQMEE		KNRQLQERLE		LAEQKLQQTM
RKAETLPEVE		AELAQRIAAL		TKAEERHGNI		EERMRHLEGQ		LEEKNQELQR
ARQREKMNEE		HNKRLSDTVD		RLLTESNERL		QLHLKERMAA		LEEKNVLIQE
SETFRKNLEE		SLHDKERLAE		EIEKLRSELD		QLKMRTGSLI		EPTIPRTHLD
TSAELRYSVG		SLVDSQSDYR		TTKVIRRPRR		GRMGVRRDEP		KVKSLGDHEW
NRTQQIGVLS		SHPFESDTEM		SDIDDDDRET		IFSSMDLLSP		SGHSDAQTLA
MMLQEQLDAI		NKEIRLIQEE		KESTELRAEE		IENRVASVSL		EGLNLARVHP
GTSITASVTA		SSLASSSPPS		GHSTPKLTPR		SPAREMDRMG		VMTLPSDLRK
HRRKIAVVEE		DGREDKATIK		CETSPPPTPR		ALRMTHTLPS		SYHNDARSSL
SVSLEPESLG		LGSANSSQDS		LHKAPKKKGI		KSSIGRLFGK		KEKARLGQLR
GFMETEAAAQ		ESLGLGKLGT		QAEKDRRLKK		KHELLEEARR		KGLPFAQWDG
PTVVAWLELW		LGMPAWYVAA		CRANVKSGAI		MSALSDTEIQ		REIGISNPLH
RLKLRLAIQE		MVSLTSPSAP		PTSRTPSGNV		WVTHEEMENL		AAPAKTKESE
EGSWAQCPVF		LQTLAYGDMN		HEWIGNEWLP		SLGLPQYRSY		FMECLVDARM
LDHLTKKDLR		VHLKMVDSFH		RTSLQYGIMC		LKRLNYDRKE		LERRREASQH
EIKDVLVWSN		DRVIRWIQAI		GLREYANNIL		ESGVHGSLIA		LDENFDYSSL
ALLLQIPTQN		TQARQILERE		YNNLLALGTE		RRLDESDDKN		FRRGSTWRRQ
FPPREVHGIS		MMPGSSETLP		AGFRLTTTSG		QSRKMTTDVA		SSRLQRLDNS
TVRTYSC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Serra-Pages C., Medley Q.G., Tang M., Hart A., Streuli M. (1998). Liprins, a family of LAR transmembrane protein-tyrosine phosphatase-interacting proteins. J. Biol. Chem. 273: 15611—15620. PMID 9624153 DOI:10.1074/jbc.273.25.15611
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 12