PPIL3

PPIL3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1XYH, 2OJU, 2OK3
Ідентифікатори
Символи	PPIL3, CYPJ, peptidylprolyl isomerase like 3
Зовнішні ІД	OMIM: 615811 MGI: 1917475 HomoloGene: 41717 GeneCards: PPIL3
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • isomerase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • згортання білків • Сплайсинг РНК • protein peptidyl-prolyl isomerization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	53938	70225
Ensembl	ENSG00000240344	ENSMUSG00000026035
UniProt	Q9H2H8	Q9D6L8
RefSeq (мРНК)	NM_032472 NM_130906 NM_131916	NM_001285826 NM_001285827 NM_027351 NM_027374
RefSeq (білок)	NP_115861 NP_570981	NP_001272755 NP_001272756 NP_081627 NP_081650
Локус (UCSC)	Хр. 2: 200.87 – 200.89 Mb	Хр. 1: 58.47 – 58.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PPIL3 (англ. Peptidylprolyl isomerase like 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 161 амінокислот, а молекулярна маса — 18 155.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSVTLHTDVG		DIKIEVFCER		TPKTCENFLA		LCASNYYNGC		IFHRNIKGFM
VQTGDPTGTG		RGGNSIWGKK		FEDEYSEYLK		HNVRGVVSMA		NNGPNTNGSQ
FFITYGKQPH		LDMKYTVFGK		VIDGLETLDE		LEKLPVNEKT		YRPLNDVHIK
DITIHANPFA		Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, ротамаз. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Huang L.-L., Zhao X.-M., Huang C.-Q., Yu L., Xia Z.-X. (2005). Structure of recombinant human cyclophilin J, a novel member of the cyclophilin family. Acta Crystallogr. D. 61: 316—321. PMID 15735342 DOI:10.1107/S0907444904033189

Див. також

• Хромосома 2