PRKAB1

PRKAB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4CFE, 4CFF, 5EZV, 4ZHX,%%s4ZHX, 5EZV
Ідентифікатори
Символи	PRKAB1, AMPK, HAMPKb, protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602740 MGI: 1336167 HomoloGene: 38160 GeneCards: PRKAB1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein kinase activity • AMP-activated protein kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • kinase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • nucleotide-activated protein kinase complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex • цитоплазма Біологічний процес • protein heterooligomerization • lipid metabolism • fatty acid metabolic process • protein phosphorylation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • fatty acid biosynthetic process • GO:0048552 regulation of catalytic activity • macroautophagy • nail development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of cold-induced thermogenesis • regulation of macroautophagy • regulation of signal transduction by p53 class mediator • фосфорилювання Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5564	19079
Ensembl	ENSG00000111725	ENSMUSG00000029513
UniProt	Q9Y478	Q9R078
RefSeq (мРНК)	NM_006253	NM_031869
RefSeq (білок)	NP_006244 NP_006244.2	NP_114075
Локус (UCSC)	Хр. 12: 119.67 – 119.68 Mb	Хр. 5: 116.15 – 116.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRKAB1 (англ. Protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 30 382.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGNTSSERAA		LERHGGHKTP		RRDSSGGTKD		GDRPKILMDS		PEDADLFHSE
EIKAPEKEEF		LAWQHDLEVN		DKAPAQARPT		VFRWTGGGKE		VYLSGSFNNW
SKLPLTRSHN		NFVAILDLPE		GEHQYKFFVD		GQWTHDPSEP		IVTSQLGTVN
NIIQVKKTDF		EVFDALMVDS		QKCSDVSELS		SSPPGPYHQE		PYVCKPEERF
RAPPILPPHL		LQVILNKDTG		ISCDPALLPE		PNHVMLNHLY		ALSIKDGVMV
LSATHRYKKK		YVTTLLYKPI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, біосинтез жирних кислот, біосинтез ліпідів.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Towler M.C., Hardie D.G. (2007). AMP-activated protein kinase in metabolic control and insulin signaling. Circ. Res. 100: 328—341. PMID 17307971 DOI:10.1161/01.RES.0000256090.42690.05
• Hardie D.G. (2007). AMP-activated/SNF1 protein kinases: conserved guardians of cellular energy. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 8: 774—785. PMID 17712357 DOI:10.1038/nrm2249

Див. також

• Хромосома 12