PSMD12

PSMD12
Ідентифікатори
Символи	PSMD12, Rpn5, p55, proteasome 26S subunit, non-ATPase 12, STISS
Зовнішні ІД	OMIM: 604450 MGI: 1914247 HomoloGene: 2109 GeneCards: PSMD12
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear proteasome complex • гіалоплазма • мембрана • proteasome accessory complex • proteasome regulatory particle • нуклеоплазма • proteasome regulatory particle, lid subcomplex • Протеасома • екзосома • extracellular region • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen Біологічний процес • regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • MAPK cascade • Fc-epsilon receptor signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • neutrophil degranulation • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5718	66997
Ensembl	ENSG00000197170	ENSMUSG00000020720
UniProt	O00232	Q9D8W5
RefSeq (мРНК)	NM_002816 NM_174871 NM_001316341	NM_025894
RefSeq (білок)	NP_001303270 NP_002807 NP_777360	NP_080170
Локус (UCSC)	Хр. 17: 67.34 – 67.37 Mb	Хр. 11: 107.37 – 107.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PSMD12 (англ. Proteasome 26S subunit, non-ATPase 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 456 амінокислот, а молекулярна маса — 52 904.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADGGSERAD		GRIVKMEVDY		SATVDQRLPE		CAKLAKEGRL		QEVIETLLSL
EKQTRTASDM		VSTSRILVAV		VKMCYEAKEW		DLLNENIMLL		SKRRSQLKQA
VAKMVQQCCT		YVEEITDLPI		KLRLIDTLRM		VTEGKIYVEI		ERARLTKTLA
TIKEQNGDVK		EAASILQELQ		VETYGSMEKK		ERVEFILEQM		RLCLAVKDYI
RTQIISKKIN		TKFFQEENTE		KLKLKYYNLM		IQLDQHEGSY		LSICKHYRAI
YDTPCIQAES		EKWQQALKSV		VLYVILAPFD		NEQSDLVHRI		SGDKKLEEIP
KYKDLLKLFT		TMELMRWSTL		VEDYGMELRK		GSLESPATDV		FGSTEEGEKR
WKDLKNRVVE		HNIRIMAKYY		TRITMKRMAQ		LLDLSVDESE		AFLSNLVVNK
TIFAKVDRLA		GIINFQRPKD		PNNLLNDWSQ		KLNSLMSLVN		KTTHLIAKEE
MIHNLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
• Huang X., Luan B., Wu J., Shi Y. (2016). An atomic structure of the human 26S proteasome. Nat. Struct. Mol. Biol. 23: 778—785. PMID 27428775 DOI:10.1038/nsmb.3273

Див. також

• Хромосома 17