PSMD4

PSMD4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1P9C, 1P9D, 1UEL, 1YX4, 1YX5, 1YX6, 2KDE, 2KDF
Ідентифікатори
Символи	PSMD4, AF, AF-1, ASF, MCB1, Rpn10, S5A, pUB-R5, proteasome 26S subunit, non-ATPase 4, proteasome 26S subunit ubiquitin receptor, non-ATPase 4
Зовнішні ІД	OMIM: 601648 MGI: 1201670 HomoloGene: 55691 GeneCards: PSMD4
Онтологія гена Молекулярна функція • polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • RNA binding Клітинна компонента • Нуклеоплазма • Протеасома • клітинне ядро • гіалоплазма • proteasome accessory complex • proteasome regulatory particle, base subcomplex Біологічний процес • regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • MAPK cascade • Fc-epsilon receptor signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • proteasome assembly • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • ubiquitin-dependent protein catabolic process • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5710	19185
Ensembl	ENSG00000159352	ENSMUSG00000005625
UniProt	P55036	O35226
RefSeq (мРНК)	NM_002810 NM_153822 NM_001330692	NM_001282017 NM_008951
RefSeq (білок)	NP_001317621 NP_002801	NP_001268946 NP_032977
Локус (UCSC)	Хр. 1: 151.25 – 151.27 Mb	Хр. 3: 94.94 – 94.95 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PSMD4 (англ. Proteasome 26S subunit, non-ATPase 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 377 амінокислот, а молекулярна маса — 40 737.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVLESTMVCV		DNSEYMRNGD		FLPTRLQAQQ		DAVNIVCHSK		TRSNPENNVG
LITLANDCEV		LTTLTPDTGR		ILSKLHTVQP		KGKITFCTGI		RVAHLALKHR
QGKNHKMRII		AFVGSPVEDN		EKDLVKLAKR		LKKEKVNVDI		INFGEEEVNT
EKLTAFVNTL		NGKDGTGSHL		VTVPPGPSLA		DALISSPILA		GEGGAMLGLG
ASDFEFGVDP		SADPELALAL		RVSMEEQRQR		QEEEARRAAA		ASAAEAGIAT
TGTEDSDDAL		LKMTISQQEF		GRTGLPDLSS		MTEEEQIAYA		MQMSLQGAEF
GQAESADIDA		SSAMDTSEPA		KEEDDYDVMQ		DPEFLQSVLE		NLPGVDPNNE
AIRNAMGSLA		SQATKDGKKD		KKEEDKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.

Література

• Ferrell K., Deveraux Q., van Nocker S., Rechsteiner M. (1996). Molecular cloning and expression of a multiubiquitin chain binding subunit of the human 26S protease. FEBS Lett. 381: 143—148. PMID 8641424 DOI:10.1016/0014-5793(96)00101-9
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Young P., Deveraux Q., Beal R.E., Pickart C.M., Rechsteiner M. (1998). Characterization of two polyubiquitin binding sites in the 26 S protease subunit 5a. J. Biol. Chem. 273: 5461—5467. PMID 9488668 DOI:10.1074/jbc.273.10.5461
• Kamitani T., Kito K., Fukuda-Kamitani T., Yeh E.T.H. (2001). Targeting of NEDD8 and its conjugates for proteasomal degradation by NUB1. J. Biol. Chem. 276: 46655—46660. PMID 11585840 DOI:10.1074/jbc.M108636200
• Ko H.S., Uehara T., Tsuruma K., Nomura Y. (2004). Ubiquilin interacts with ubiquitylated proteins and proteasome through its ubiquitin-associated and ubiquitin-like domains. FEBS Lett. 566: 110—114. PMID 15147878 DOI:10.1016/j.febslet.2004.04.031
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Див. також

• Хромосома 1