PSME1

PSME1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1AVO
Ідентифікатори
Символи	PSME1, IFI5111, PA28A, PA28alpha, REGalpha, HEL-S-129m, proteasome activator subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600654 MGI: 1096367 HomoloGene: 4560 GeneCards: PSME1
Онтологія гена Молекулярна функція • endopeptidase activator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • Протеасома • цитоплазма • нуклеоплазма • proteasome activator complex • гіалоплазма • екзосома Біологічний процес • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • protein polyubiquitination • T cell receptor signaling pathway • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • regulation of proteasomal protein catabolic process • regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • regulation of mRNA stability • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • antigen processing and presentation of exogenous antigen • regulation of cellular amino acid metabolic process • NIK/NF-kappaB signaling • Fc-epsilon receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • MAPK cascade • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • positive regulation of endopeptidase activity • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5720	19186
Ensembl	ENSG00000092010 ENSG00000284916	ENSMUSG00000022216
UniProt	Q06323	P97371
RefSeq (мРНК)	NM_176783 NM_001281528 NM_001281529 NM_006263	NM_011189
RefSeq (білок)	NP_001268457 NP_001268458 NP_006254 NP_788955	NP_035319
Локус (UCSC)	Хр. 14: 24.14 – 24.14 Mb	Хр. 14: 55.82 – 55.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PSME1 (англ. Proteasome activator subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 249 амінокислот, а молекулярна маса — 28 723.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAMLRVQPEA		QAKVDVFRED		LCTKTENLLG		SYFPKKISEL		DAFLKEPALN
EANLSNLKAP		LDIPVPDPVK		EKEKEERKKQ		QEKEDKDEKK		KGEDEDKGPP
CGPVNCNEKI		VVLLQRLKPE		IKDVIEQLNL		VTTWLQLQIP		RIEDGNNFGV
AVQEKVFELM		TSLHTKLEGF		HTQISKYFSE		RGDAVTKAAK		QPHVGDYRQL
VHELDEAEYR		DIRLMVMEIR		NAYAVLYDII		LKNFEKLKKP		RGETKGMIY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• Honore B., Leffers H., Madsen P., Celis J.E. (1993). Interferon-gamma up-regulates a unique set of proteins in human keratinocytes. Molecular cloning and expression of the cDNA encoding the RGD-sequence-containing protein IGUP I-5111. Eur. J. Biochem. 218: 421—430. PMID 8269930 DOI:10.1111/j.1432-1033.1993.tb18392.x
• McCusker D., Wilson M., Trowsdale J. (1999). Organization of the genes encoding the human proteasome activators PA28alpha and beta. Immunogenetics. 49: 438—445. PMID 10199920 DOI:10.1007/s002510050517
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Johnston S.C., Whitby F.G., Realini C., Rechsteiner M., Hill C.P. (1997). The proteasome 11S regulator subunit REG alpha (PA28 alpha) is a heptamer. Protein Sci. 6: 2469—2473. PMID 9385652 DOI:10.1002/pro.5560061123
• Realini C., Dubiel W., Pratt G., Ferrell K., Rechsteiner M. (1994). Molecular cloning and expression of a gamma-interferon-inducible activator of the multicatalytic protease. J. Biol. Chem. 269: 20727—20732. PMID 8051173

Див. також

• Хромосома 14