PTCHD4

PTCHD4
Ідентифікатори
Символи	PTCHD4, C6orf138, dJ402H5.2, PTCH53, patched domain containing 4
Зовнішні ІД	OMIM: 616908 MGI: 1920485 HomoloGene: 78322 GeneCards: PTCHD4
Онтологія гена Молекулярна функція • молекулярна функція Клітинна компонента • мембрана • integral component of membrane • компонент клітини Біологічний процес • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	442213	627626
Ensembl	ENSG00000244694	ENSMUSG00000042256
UniProt	Q6ZW05	B9EKX1
RefSeq (мРНК)	NM_001013732 NM_207499 NM_001384253	NM_028474 NM_001355270
RefSeq (білок)	NP_001013754 NP_997382	NP_082750 NP_001342199
Локус (UCSC)	Хр. 6: 47.86 – 48.11 Mb	Хр. 17: 42.63 – 42.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTCHD4 (англ. Patched domain containing 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 846 амінокислот, а молекулярна маса — 96 371.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MCFLRRPGAP		ASWIWWRMLR		QVLRRGLQSF		CHRLGLCVSR		HPVFFLTVPA
VLTITFGLSA		LNRFQPEGDL		ERLVAPSHSL		AKIERSLASS		LFPLDQSKSQ
LYSDLHTPGR		YGRVILLSPT		GDNILLQAEG		ILQTHRAVLE		MKDGRNSFIG
HQLGGVVEVP		NSKDQRVKSA		RAIQITYYLQ		TYGSATQDLI		GEKWENEFCK
LIRKLQEEHQ		ELQLYSLASF		SLWRDFHKTS		ILARSKVLVS		LVLILTTATL
SSSMKDCLRS		KPFLGLLGVL		TVCISIITAA		GIFFITDGKY		NSTLLGIPFF
AMGHGTKGVF		ELLSGWRRTK		ENLPFKDRIA		DAYSDVMVTY		TMTSSLYFIT
FGMGASPFTN		IEAVKVFCQN		MCVSILLNYF		YIFSFFGSCL		VFAGQLEQNR
YHSIFCCKIP		SAEYLDRKPV		WFQTVMSDGH		QQTSHHETNP		YQHHFIQHFL
REHYNEWITN		IYVKPFVVIL		YLIYASFSFM		GCLQISDGAN		IINLLASDSP
SVSYAMVQQK		YFSNYSPVIG		FYVYEPLEYW		NSSVQDDLRR		LCSGFTAVSW
VEQYYQFLKV		SNVSANNKSD		FISVLQSSFL		KKPEFQHFRN		DIIFSKAGDE
SNIIASRLYL		VARTSRDKQK		EITEVLEKLR		PLSLSKSIRF		IVFNPSFVFM
DHYSLSVTVP		VLIAGFGVLL		VLILTFFLVI		HPLGNFWLIL		SVTSIELGVL
GLMTLWNVDM		DCISILCLIY		TLNFAIDHCA		PLLFTFVLAT		EHTRTQCIKS
SLQDHGTAIL		QNVTSFLIGL		VPLLFVPSNL		TFTLFKCLLL		TGGCTLLHCF
VILPVFLTFF		PPSKKHHKKK		KRAKRKEREE		IECIEIQENP		DHVTTV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• Chung J.H., Larsen A.R., Chen E., Bunz F. (2014). A PTCH1 homolog transcriptionally activated by p53 suppresses hedgehog signaling. J. Biol. Chem. 289: 33020—33031. PMID 25296753 DOI:10.1074/jbc.M114.597203
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6