PTPN4

PTPN4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CS5, 2VPH, 3NFK, 3NFL, 2I75, 5EZ0, 5EYZ
Ідентифікатори
Символи	PTPN4, MEG, PTPMEG, PTPMEG1, protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4
Зовнішні ІД	OMIM: 176878 MGI: 1099792 HomoloGene: 2120 GeneCards: PTPN4
Онтологія гена Молекулярна функція • protein tyrosine phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • cytoskeletal protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphoprotein phosphatase activity • hydrolase activity • non-membrane spanning protein tyrosine phosphatase activity Клітинна компонента • цитоплазма • cytoplasmic side of plasma membrane • клітинна мембрана • цитоскелет • мембрана • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0016576 protein dephosphorylation • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • cellular response to cytokine stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5775	19258
Ensembl	ENSG00000088179	ENSMUSG00000026384
UniProt	P29074	Q9WU22
RefSeq (мРНК)	NM_002830	NM_019933
RefSeq (білок)	NP_002821	NP_064317
Локус (UCSC)	Хр. 2: 119.76 – 119.98 Mb	Хр. 1: 119.65 – 119.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTPN4 (англ. Protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 926 амінокислот, а молекулярна маса — 105 911.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSRFRLPAG		RTYNVRASEL		ARDRQHTEVV		CNILLLDNTV		QAFKVNKHDQ
GQVLLDVVFK		HLDLTEQDYF		GLQLADDSTD		NPRWLDPNKP		IRKQLKRGSP
YSLNFRVKFF		VSDPNKLQEE		YTRYQYFLQI		KQDILTGRLP		CPSNTAALLA
SFAVQSELGD		YDQSENLSGY		LSDYSFIPNQ		PQDFEKEIAK		LHQQHIGLSP
AEAEFNYLNT		ARTLELYGVE		FHYARDQSNN		EIMIGVMSGG		ILIYKNRVRM
NTFPWLKIVK		ISFKCKQFFI		QLRKELHESR		ETLLGFNMVN		YRACKNLWKA
CVEHHTFFRL		DRPLPPQKNF		FAHYFTLGSK		FRYCGRTEVQ		SVQYGKEKAN
KDRVFARSPS		KPLARKLMDW		EVVSRNSISD		DRLETQSLPS		RSPPGTPNHR
NSTFTQEGTR		LRPSSVGHLV		DHMVHTSPSE		VFVNQRSPSS		TQANSIVLES
SPSQETPGDG		KPPALPPKQS		KKNSWNQIHY		SHSQQDLESH		INETFDIPSS
PEKPTPNGGI		PHDNLVLIRM		KPDENGRFGF		NVKGGYDQKM		PVIVSRVAPG
TPADLCVPRL		NEGDQVVLIN		GRDIAEHTHD		QVVLFIKASC		ERHSGELMLL
VRPNAVYDVV		EEKLENEPDF		QYIPEKAPLD		SVHQDDHSLR		ESMIQLAEGL
ITGTVLTQFD		QLYRKKPGMT		MSCAKLPQNI		SKNRYRDISP		YDATRVILKG
NEDYINANYI		NMEIPSSSII		NQYIACQGPL		PHTCTDFWQM		TWEQGSSMVV
MLTTQVERGR		VKCHQYWPEP		TGSSSYGCYQ		VTCHSEEGNT		AYIFRKMTLF
NQEKNESRPL		TQIQYIAWPD		HGVPDDSSDF		LDFVCHVRNK		RAGKEEPVVV
HCSAGIGRTG		VLITMETAMC		LIECNQPVYP		LDIVRTMRDQ		RAMMIQTPSQ
YRFVCEAILK		VYEEGFVKPL		TTSTNK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

• Gu M., York J.D., Warshawsky I., Majerus P.W. (1991). Identification, cloning, and expression of a cytosolic megakaryocyte protein-tyrosine-phosphatase with sequence homology to cytoskeletal protein 4.1. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 5867—5871. PMID 1648233 DOI:10.1073/pnas.88.13.5867
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Honda H., Shibuya M., Chiba S., Yazaki Y., Hirai H. (1993). Identification of novel protein-tyrosine phosphatases in a human leukemia cell line, F-36P. Leukemia. 7: 742—746. PMID 8483328

Див. також

• Хромосома 2