PTPRA

PTPRA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1P15, 1YFO
Ідентифікатори
Символи	PTPRA, HEPTP, HLPR, HPTPA, HPTPalpha, LRP, PTPA, PTPRL2, R-PTP-alpha, RPTPA, protein tyrosine phosphatase, receptor type A, protein tyrosine phosphatase receptor type A
Зовнішні ІД	OMIM: 176884 MGI: 97808 HomoloGene: 20621 GeneCards: PTPRA
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • protein tyrosine phosphatase activity • phosphoprotein phosphatase activity • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • receptor complex • integral component of plasma membrane • integral component of membrane • мембрана • екзосома • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • Schaffer collateral - CA1 synapse • integral component of synaptic membrane Біологічний процес • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • axon guidance • protein phosphorylation • GO:0016576 protein dephosphorylation • MAPK cascade • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • GO:1901047 insulin receptor signaling pathway • regulation of molecular function • modulation of chemical synaptic transmission Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5786	19262
Ensembl	ENSG00000132670	ENSMUSG00000027303
UniProt	P18433 Q5JWG0	P18052
RefSeq (мРНК)	NM_080841 NM_002836 NM_080840	NM_001163688 NM_008980 NM_001355161
RefSeq (білок)	NP_002827 NP_543030 NP_543031	NP_001157160 NP_033006 NP_001342090
Локус (UCSC)	Хр. 20: 2.86 – 3.04 Mb	Хр. 2: 130.29 – 130.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTPRA (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 802 амінокислот, а молекулярна маса — 90 600.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSWFILVLL		GSGLICVSAN		NATTVAPSVG		ITRLINSSTA		EPVKEEAKTS
NPTSSLTSLS		VAPTFSPNIT		LGPTYLTTVN		SSDSDNGTTR		TASTNSIGIT
ISPNGTWLPD		NQFTDARTEP		WEGNSSTAAT		TPETFPPSDE		TPIIAVMVAL
SSLLVIVFII		IVLYMLRFKK		YKQAGSHSNS		KQAGSHSNSF		RLSNGRTEDV
EPQSVPLLAR		SPSTNRKYPP		LPVDKLEEEI		NRRMADDNKL		FREEFNALPA
CPIQATCEAA		SKEENKEKNR		YVNILPYDHS		RVHLTPVEGV		PDSDYINASF
INGYQEKNKF		IAAQGPKEET		VNDFWRMIWE		QNTATIVMVT		NLKERKECKC
AQYWPDQGCW		TYGNIRVSVE		DVTVLVDYTV		RKFCIQQVGD		MTNRKPQRLI
TQFHFTSWPD		FGVPFTPIGM		LKFLKKVKAC		NPQYAGAIVV		HCSAGVGRTG
TFVVIDAMLD		MMHTERKVDV		YGFVSRIRAQ		RCQMVQTDMQ		YVFIYQALLE
HYLYGDTELE		VTSLETHLQK		IYNKIPGTSN		NGLEEEFKKL		TSIKIQNDKM
RTGNLPANMK		KNRVLQIIPY		EFNRVIIPVK		RGEENTDYVN		ASFIDGYRQK
DSYIASQGPL		LHTIEDFWRM		IWEWKSCSIV		MLTELEERGQ		EKCAQYWPSD
GLVSYGDITV		ELKKEEECES		YTVRDLLVTN		TRENKSRQIR		QFHFHGWPEV
GIPSDGKGMI		SIIAAVQKQQ		QQSGNHPITV		HCSAGAGRTG		TFCALSTVLE
RVKAEGILDV		FQTVKSLRLQ		RPHMVQTLEQ		YEFCYKVVQE		YIDAFSDYAN
FK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• Sap J., D'Eustachio P., Givol D., Schlessinger J. (1990). Cloning and expression of a widely expressed receptor tyrosine phosphatase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 6112—6116. PMID 2166945 DOI:10.1073/pnas.87.16.6112
• Ohagi S., Nishi M., Steiner D.F. (1990). Sequence of a cDNA encoding human LRP (leukocyte common antigen-related peptide). Nucleic Acids Res. 18: 7159—7159. PMID 2175890 DOI:10.1093/nar/18.23.7159
• Jirik F.R., Janzen N.M., Melhado I.G., Harder K.W. (1990). Cloning and chromosomal assignment of a widely expressed human receptor-like protein-tyrosine phosphatase. FEBS Lett. 273: 239—242. PMID 2172030 DOI:10.1016/0014-5793(90)81094-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Krueger N.X., Streuli M., Saito H. (1990). Structural diversity and evolution of human receptor-like protein tyrosine phosphatases. EMBO J. 9: 3241—3252. PMID 2170109

Див. також

• Хромосома 20