PTPRG

PTPRG
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2H4V, 2HY3, 2NLK, 2PBN, 3JXH, 3QCB, 3QCC, 3QCD, 3QCE, 3QCF, 3QCG, 3QCH, 3QCI, 3QCJ, 3QCK, 3QCL, 3QCM, 3QCN
Ідентифікатори
Символи	PTPRG, HPTPG, PTPG, R-PTP-GAMMA, RPTPG, protein tyrosine phosphatase, receptor type G, protein tyrosine phosphatase receptor type G
Зовнішні ІД	OMIM: 176886 MGI: 97814 HomoloGene: 2129 GeneCards: PTPRG
Пов'язані генетичні захворювання
Fuchs' endothelial dystrophy
Онтологія гена Молекулярна функція • protein tyrosine phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphoprotein phosphatase activity • hydrolase activity • identical protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • екзосома • мембрана • міжклітинний простір Біологічний процес • regulation of homophilic cell adhesion • GO:0016576 protein dephosphorylation • negative regulation of epithelial cell migration • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • brain development • negative regulation of neuron projection development • peptidyl-tyrosine dephosphorylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5793	19270
Ensembl	ENSG00000144724	н/д
UniProt	P23470	Q05909
RefSeq (мРНК)	NM_002841 NM_001375471	NM_008981 NM_001347593
RefSeq (білок)	NP_002832 NP_001362400	NP_001334522 NP_033007
Локус (UCSC)	Хр. 3: 61.56 – 62.3 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTPRG (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type G) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 445 амінокислот, а молекулярна маса — 162 003.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRRLLEPCWW		ILFLKITSSV		LHYVVCFPAL		TEGYVGALHE		NRHGSAVQIR
RRKASGDPYW		AYSGAYGPEH		WVTSSVSCGG		RHQSPIDILD		QYARVGEEYQ
ELQLDGFDNE		SSNKTWMKNT		GKTVAILLKD		DYFVSGAGLP		GRFKAEKVEF
HWGHSNGSAG		SEHSINGRRF		PVEMQIFFYN		PDDFDSFQTA		ISENRIIGAM
AIFFQVSPRD		NSALDPIIHG		LKGVVHHEKE		TFLDPFVLRD		LLPASLGSYY
RYTGSLTTPP		CSEIVEWIVF		RRPVPISYHQ		LEAFYSIFTT		EQQDHVKSVE
YLRNNFRPQQ		RLHDRVVSKS		AVRDSWNHDM		TDFLENPLGT		EASKVCSSPP
IHMKVQPLNQ		TALQVSWSQP		ETIYHPPIMN		YMISYSWTKN		EDEKEKTFTK
DSDKDLKATI		SHVSPDSLYL		FRVQAVCRND		MRSDFSQTML		FQANTTRIFQ
GTRIVKTGVP		TASPASSADM		APISSGSSTW		TSSGIPFSFV		SMATGMGPSS
SGSQATVASV		VTSTLLAGLG		FGGGGISSFP		STVWPTRLPT		AASASKQAAR
PVLATTEALA		SPGPDGDSSP		TKDGEGTEEG		EKDEKSESED		GEREHEEDGE
KDSEKKEKSG		VTHAAEERNQ		TEPSPTPSSP		NRTAEGGHQT		IPGHEQDHTA
VPTDQTGGRR		DAGPGLDPDM		VTSTQVPPTA		TEEQYAGSDP		KRPEMPSKKP
MSRGDRFSED		SRFITVNPAE		KNTSGMISRP		APGRMEWIIP		LIVVSALTFV
CLILLIAVLV		YWRGCNKIKS		KGFPRRFREV		PSSGERGEKG		SRKCFQTAHF
YVEDSSSPRV		VPNESIPIIP		IPDDMEAIPV		KQFVKHIGEL		YSNNQHGFSE
DFEEVQRCTA		DMNITAEHSN		HPENKHKNRY		INILAYDHSR		VKLRPLPGKD
SKHSDYINAN		YVDGYNKAKA		YIATQGPLKS		TFEDFWRMIW		EQNTGIIVMI
TNLVEKGRRK		CDQYWPTENS		EEYGNIIVTL		KSTKIHACYT		VRRFSIRNTK
VKKGQKGNPK		GRQNERVVIQ		YHYTQWPDMG		VPEYALPVLT		FVRRSSAARM
PETGPVLVHC		SAGVGRTGTY		IVIDSMLQQI		KDKSTVNVLG		FLKHIRTQRN
YLVQTEEQYI		FIHDALLEAI		LGKETEVSSN		QLHSYVNSIL		IPGVGGKTRL
EKQFKLVTQC		NAKYVECFSA		QKECNKEKNR		NSSVVPSERA		RVGLAPLPGM
KGTDYINASY		IMGYYRSNEF		IITQHPLPHT		TKDFWRMIWD		HNAQIIVMLP
DNQSLAEDEF		VYWPSREESM		NCEAFTVTLI		SKDRLCLSNE		EQIIIHDFIL
EATQDDYVLE		VRHFQCPKWP		NPDAPISSTF		ELINVIKEEA		LTRDGPTIVH
DEYGAVSAGM		LCALTTLSQQ		LENENAVDVF		QVAKMINLMR		PGVFTDIEQY
QFIYKAMLSL		VSTKENGNGP		MTVDKNGAVL		IADESDPAES		MESLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bouyain S., Watkins D.J. (2010). The protein tyrosine phosphatases PTPRZ and PTPRG bind to distinct members of the contactin family of neural recognition molecules. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 2443—2448. PMID 20133774 DOI:10.1073/pnas.0911235107
• Krueger N.X., Streuli M., Saito H. (1990). Structural diversity and evolution of human receptor-like protein tyrosine phosphatases. EMBO J. 9: 3241—3252. PMID 2170109

Див. також

• Хромосома 3