PTPRK

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
PTPRK
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PTPRK, R-PTP-kappa, protein tyrosine phosphatase, receptor type K, protein tyrosine phosphatase receptor type K
Зовнішні ІД OMIM: 602545 MGI: 103310 HomoloGene: 55693 GeneCards: PTPRK
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_008983
NM_001359355
NM_001359356
RefSeq (білок)
NP_033009
NP_001346284
NP_001346285
Локус (UCSC) Хр. 6: 127.97 – 128.52 Mb Хр. 10: 27.95 – 28.47 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PTPRK (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type K) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 439 амінокислот, а молекулярна маса — 162 102[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDTTAAAALPAFVALLLLSPWPLLGSAQGQFSAGGCTFDDGPGACDYHQD
LYDDFEWVHVSAQEPHYLPPEMPQGSYMIVDSSDHDPGEKARLQLPTMKE
NDTHCIDFSYLLYSQKGLNPGTLNILVRVNKGPLANPIWNVTGFTGRDWL
RAELAVSTFWPNEYQVIFEAEVSGGRSGYIAIDDIQVLSYPCDKSPHFLR
LGDVEVNAGQNATFQCIATGRDAVHNKLWLQRRNGEDIPVAQTKNINHRR
FAASFRLQEVTKTDQDLYRCVTQSERGSGVSNFAQLIVREPPRPIAPPQL
LGVGPTYLLIQLNANSIIGDGPIILKEVEYRMTSGSWTETHAVNAPTYKL
WHLDPDTEYEIRVLLTRPGEGGTGLPGPPLITRTKCAEPMRTPKTLKIAE
IQARRIAVDWESLGYNITRCHTFNVTICYHYFRGHNESKADCLDMDPKAP
QHVVNHLPPYTNVSLKMILTNPEGRKESEETIIQTDEDVPGPVPVKSLQG
TSFENKIFLNWKEPLDPNGIITQYEISYSSIRSFDPAVPVAGPPQTVSNL
WNSTHHVFMHLHPGTTYQFFIRASTVKGFGPATAINVTTNISAPTLPDYE
GVDASLNETATTITVLLRPAQAKGAPISAYQIVVEELHPHRTKREAGAME
CYQVPVTYQNAMSGGAPYYFAAELPPGNLPEPAPFTVGDNRTYQGFWNPP
LAPRKGYNIYFQAMSSVEKETKTQCVRIATKAATEEPEVIPDPAKQTDRV
VKIAGISAGILVFILLLLVVILIVKKSKLAKKRKDAMGNTRQEMTHMVNA
MDRSYADQSTLHAEDPLSITFMDQHNFSPRYENHSATAESSRLLDVPRYL
CEGTESPYQTGQLHPAIRVADLLQHINLMKTSDSYGFKEEYESFFEGQSA
SWDVAKKDQNRAKNRYGNIIAYDHSRVILQPVEDDPSSDYINANYIDGYQ
RPSHYIATQGPVHETVYDFWRMIWQEQSACIVMVTNLVEVGRVKCYKYWP
DDTEVYGDFKVTCVEMEPLAEYVVRTFTLERRGYNEIREVKQFHFTGWPD
HGVPYHATGLLSFIRRVKLSNPPSAGPIVVHCSAGAGRTGCYIVIDIMLD
MAEREGVVDIYNCVKALRSRRINMVQTEEQYIFIHDAILEACLCGETAIP
VCEFKAAYFDMIRIDSQTNSSHLKDEFQTLNSVTPRLQAEDCSIACLPRN
HDKNRFMDMLPPDRCLPFLITIDGESSNYINAALMDSYRQPAAFIVTQYP
LPNTVKDFWRLVYDYGCTSIVMLNEVDLSQGCPQYWPEEGMLRYGPIQVE
CMSCSMDCDVINRIFRICNLTRPQEGYLMVQQFQYLGWASHREVPGSKRS
FLKLILQVEKWQEECEEGEGRTIIHCLNGGGRSGMFCAIGIVVEMVKRQN
VVDVFHAVKTLRNSKPNMVEAPEQYRFCYDVALEYLESS

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

[ред. | ред. код]
  • Fuchs M., Mueller T., Lerch M., Ullrich A. (1996). Association of human protein-tyrosine phosphatase kappa with members of the armadillo family. J. Biol. Chem. 271: 16712—16719. PMID 8663237 DOI:10.1074/jbc.271.28.16712
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9674 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, Q15262 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]