PTPRZ1

PTPRZ1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3JXF, 3S97, 5AWX
Ідентифікатори
Символи	PTPRZ1, HPTPZ, HPTPzeta, PTP-ZETA, PTP18, PTPRZ, PTPZ, R-PTP-zeta-2, RPTPB, RPTPbeta, phosphacan, protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, protein tyrosine phosphatase receptor type Z1
Зовнішні ІД	OMIM: 176891 MGI: 97816 HomoloGene: 2136 GeneCards: PTPRZ1
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphoprotein phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine phosphatase activity • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • hydrolase activity • integrin binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • perineuronal net • intrinsic component of plasma membrane • клітинна мембрана • GO:0005578 Позаклітинна матриця • синапс Біологічний процес • аксоноґенеза • GO:0016576 protein dephosphorylation • oligodendrocyte differentiation • regulation of oligodendrocyte progenitor proliferation • central nervous system development • hematopoietic progenitor cell differentiation • learning or memory • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • cytokine-mediated signaling pathway • regulation of myelination • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • positive regulation of oligodendrocyte differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5803	19283
Ensembl	ENSG00000106278	ENSMUSG00000068748
UniProt	P23471	B9EKR1
RefSeq (мРНК)	NM_001206838 NM_001206839 NM_002851 NM_001369395 NM_001369396	NM_001081306 NM_011219 NM_178180 NM_001311064 NM_001361349
RefSeq (білок)	NP_001193767 NP_001193768 NP_002842	NP_001074775 NP_001297993 NP_001348278 NP_035349 NP_001389981 NP_001389982 NP_001389983
Локус (UCSC)	Хр. 7: 121.87 – 122.06 Mb	Хр. 6: 22.88 – 23.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTPRZ1 (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 315 амінокислот, а молекулярна маса — 254 587.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRILKRFLAC		IQLLCVCRLD		WANGYYRQQR		KLVEEIGWSY		TGALNQKNWG
KKYPTCNSPK		QSPINIDEDL		TQVNVNLKKL		KFQGWDKTSL		ENTFIHNTGK
TVEINLTNDY		RVSGGVSEMV		FKASKITFHW		GKCNMSSDGS		EHSLEGQKFP
LEMQIYCFDA		DRFSSFEEAV		KGKGKLRALS		ILFEVGTEEN		LDFKAIIDGV
ESVSRFGKQA		ALDPFILLNL		LPNSTDKYYI		YNGSLTSPPC		TDTVDWIVFK
DTVSISESQL		AVFCEVLTMQ		QSGYVMLMDY		LQNNFREQQY		KFSRQVFSSY
TGKEEIHEAV		CSSEPENVQA		DPENYTSLLV		TWERPRVVYD		TMIEKFAVLY
QQLDGEDQTK		HEFLTDGYQD		LGAILNNLLP		NMSYVLQIVA		ICTNGLYGKY
SDQLIVDMPT		DNPELDLFPE		LIGTEEIIKE		EEEGKDIEEG		AIVNPGRDSA
TNQIRKKEPQ		ISTTTHYNRI		GTKYNEAKTN		RSPTRGSEFS		GKGDVPNTSL
NSTSQPVTKL		ATEKDISLTS		QTVTELPPHT		VEGTSASLND		GSKTVLRSPH
MNLSGTAESL		NTVSITEYEE		ESLLTSFKLD		TGAEDSSGSS		PATSAIPFIS
ENISQGYIFS		SENPETITYD		VLIPESARNA		SEDSTSSGSE		ESLKDPSMEG
NVWFPSSTDI		TAQPDVGSGR		ESFLQTNYTE		IRVDESEKTT		KSFSAGPVMS
QGPSVTDLEM		PHYSTFAYFP		TEVTPHAFTP		SSRQQDLVST		VNVVYSQTTQ
PVYNGETPLQ		PSYSSEVFPL		VTPLLLDNQI		LNTTPAASSS		DSALHATPVF
PSVDVSFESI		LSSYDGAPLL		PFSSASFSSE		LFRHLHTVSQ		ILPQVTSATE
SDKVPLHASL		PVAGGDLLLE		PSLAQYSDVL		STTHAASETL		EFGSESGVLY
KTLMFSQVEP		PSSDAMMHAR		SSGPEPSYAL		SDNEGSQHIF		TVSYSSAIPV
HDSVGVTYQG		SLFSGPSHIP		IPKSSLITPT		ASLLQPTHAL		SGDGEWSGAS
SDSEFLLPDT		DGLTALNISS		PVSVAEFTYT		TSVFGDDNKA		LSKSEIIYGN
ETELQIPSFN		EMVYPSESTV		MPNMYDNVNK		LNASLQETSV		SISSTKGMFP
GSLAHTTTKV		FDHEISQVPE		NNFSVQPTHT		VSQASGDTSL		KPVLSANSEP
ASSDPASSEM		LSPSTQLLFY		ETSASFSTEV		LLQPSFQASD		VDTLLKTVLP
AVPSDPILVE		TPKVDKISST		MLHLIVSNSA		SSENMLHSTS		VPVFDVSPTS
HMHSASLQGL		TISYASEKYE		PVLLKSESSH		QVVPSLYSND		ELFQTANLEI
NQAHPPKGRH		VFATPVLSID		EPLNTLINKL		IHSDEILTST		KSSVTGKVFA
GIPTVASDTF		VSTDHSVPIG		NGHVAITAVS		PHRDGSVTST		KLLFPSKATS
ELSHSAKSDA		GLVGGGEDGD		TDDDGDDDDD		DRGSDGLSIH		KCMSCSSYRE
SQEKVMNDSD		THENSLMDQN		NPISYSLSEN		SEEDNRVTSV		SSDSQTGMDR
SPGKSPSANG		LSQKHNDGKE		ENDIQTGSAL		LPLSPESKAW		AVLTSDEESG
SGQGTSDSLN		ENETSTDFSF		ADTNEKDADG		ILAAGDSEIT		PGFPQSPTSS
VTSENSEVFH		VSEAEASNSS		HESRIGLAEG		LESEKKAVIP		LVIVSALTFI
CLVVLVGILI		YWRKCFQTAH		FYLEDSTSPR		VISTPPTPIF		PISDDVGAIP
IKHFPKHVAD		LHASSGFTEE		FETLKEFYQE		VQSCTVDLGI		TADSSNHPDN
KHKNRYINIV		AYDHSRVKLA		QLAEKDGKLT		DYINANYVDG		YNRPKAYIAA
QGPLKSTAED		FWRMIWEHNV		EVIVMITNLV		EKGRRKCDQY		WPADGSEEYG
NFLVTQKSVQ		VLAYYTVRNF		TLRNTKIKKG		SQKGRPSGRV		VTQYHYTQWP
DMGVPEYSLP		VLTFVRKAAY		AKRHAVGPVV		VHCSAGVGRT		GTYIVLDSML
QQIQHEGTVN		IFGFLKHIRS		QRNYLVQTEE		QYVFIHDTLV		EAILSKETEV
LDSHIHAYVN		ALLIPGPAGK		TKLEKQFQLL		SQSNIQQSDY		SAALKQCNRE
KNRTSSIIPV		ERSRVGISSL		SGEGTDYINA		SYIMGYYQSN		EFIITQHPLL
HTIKDFWRMI		WDHNAQLVVM		IPDGQNMAED		EFVYWPNKDE		PINCESFKVT
LMAEEHKCLS		NEEKLIIQDF		ILEATQDDYV		LEVRHFQCPK		WPNPDSPISK
TFELISVIKE		EAANRDGPMI		VHDEHGGVTA		GTFCALTTLM		HQLEKENSVD
VYQVAKMINL		MRPGVFADIE		QYQFLYKVIL		SLVSTRQEEN		PSTSLDSNGA
ALPDGNIAES		LESLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Krueger N.X., Saito H. (1992). A human transmembrane protein-tyrosine-phosphatase, PTP zeta, is expressed in brain and has an N-terminal receptor domain homologous to carbonic anhydrases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 7417—7421. PMID 1323835 DOI:10.1073/pnas.89.16.7417
• Onyango P., Lubyova B., Gardellin P., Kurzbauer R., Weith A. (1998). Molecular cloning and expression analysis of five novel genes in chromosome 1p36. Genomics. 50: 187—198. PMID 9653645 DOI:10.1006/geno.1997.5186
• Bouyain S., Watkins D.J. (2010). The protein tyrosine phosphatases PTPRZ and PTPRG bind to distinct members of the contactin family of neural recognition molecules. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 2443—2448. PMID 20133774 DOI:10.1073/pnas.0911235107
• Krueger N.X., Streuli M., Saito H. (1990). Structural diversity and evolution of human receptor-like protein tyrosine phosphatases. EMBO J. 9: 3241—3252. PMID 2170109

Див. також

• Хромосома 7