PUM2

PUM2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3Q0Q, 3Q0R, 3Q0S
Ідентифікатори
Символи	PUM2, PUMH2, PUML2, pumilio RNA binding family member 2
Зовнішні ІД	OMIM: 607205 MGI: 1931751 HomoloGene: 69183 GeneCards: PUM2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • mRNA 3'-UTR binding • miRNA binding Клітинна компонента • perinuclear region of cytoplasm • cytoplasmic stress granule • ядерна мембрана • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • regulation of chromosome segregation • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • positive regulation of RIG-I signaling pathway • regulation of translation • regulation of mRNA stability • GO:1905618 positive regulation of gene silencing by miRNA • stress granule assembly • posttranscriptional regulation of gene expression • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23369	80913
Ensembl	ENSG00000055917	ENSMUSG00000020594
UniProt	Q8TB72	Q80U58
RefSeq (мРНК)	NM_001282752 NM_001282790 NM_001282791 NM_015317 NM_001352917 NM_001352918 NM_001352919 NM_001352920 NM_001352923 NM_001352925 NM_001352926 NM_001352927 NM_001352928 NM_001352929 NM_001352930	NM_001160219 NM_001160220 NM_001160221 NM_001160222 NM_030723 NM_001310519
RefSeq (білок)	NP_001269681 NP_001269719 NP_001269720 NP_056132 NP_001339846 NP_001339847 NP_001339848 NP_001339849 NP_001339852 NP_001339854 NP_001339855 NP_001339856 NP_001339857 NP_001339858 NP_001339859	NP_001153691 NP_001153692 NP_001153693 NP_001153694 NP_001297448 NP_109648
Локус (UCSC)	Хр. 2: 20.25 – 20.35 Mb	Хр. 12: 8.72 – 8.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PUM2 (англ. Pumilio RNA binding family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 066 амінокислот, а молекулярна маса — 114 216.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNHDFQALAL		ESRGMGELLP		TKKFWEPDDS		TKDGQKGIFL		GDDEWRETAW
GASHHSMSQP		IMVQRRSGQG		FHGNSEVNAI		LSPRSESGGL		GVSMVEYVLS
SSPADKLDSR		FRKGNFGTRD		AETDGPEKGD		QKGKASPFEE		DQNRDLKQGD
DDDSKINGRG		LPNGMDADCK		DFNRTPGSRQ		ASPTEVVERL		GPNTNPSEGL
GPLPNPTANK		PLVEEFSNPE		TQNLDAMEQV		GLESLQFDYP		GNQVPMDSSG
ATVGLFDYNS		QQQLFQRTNA		LTVQQLTAAQ		QQQYALAAAQ		QPHIAGVFSA
GLAPAAFVPN		PYIISAAPPG		TDPYTAAGLA		AAATLAGPAV		VPPQYYGVPW
GVYPANLFQQ		QAAAAANNTA		SQQAASQAQP		GQQQVLRAGA		GQRPLTPNQG
QQGQQAESLA		AAAAANPTLA		FGQGLATGMP		GYQVLAPTAY		YDQTGALVVG
PGARTGLGAP		VRLMAPTPVL		ISSAAAQAAA		AAAAGGTASS		LTGSTNGLFR
PIGTQPPQQQ		QQQPSTNLQS		NSFYGSSSLT		NSSQSSSLFS		HGPGQPGSTS
LGFGSGNSLG		AAIGSALSGF		GSSVGSSASS		SATRRESLST		SSDLYKRSSS
SLAPIGQPFY		NSLGFSSSPS		PIGMPLPSQT		PGHSLTPPPS		LSSHGSSSSL
HLGGLTNGSG		RYISAAPGAE		AKYRSASSTS		SLFSSSSQLF		PPSRLRYNRS
DIMPSGRSRL		LEDFRNNRFP		NLQLRDLIGH		IVEFSQDQHG		SRFIQQKLER
ATPAERQMVF		NEILQAAYQL		MTDVFGNYVI		QKFFEFGSLD		QKLALATRIR
GHVLPLALQM		YGCRVIQKAL		ESISSDQQVI		SEMVKELDGH		VLKCVKDQNG
NHVVQKCIEC		VQPQSLQFII		DAFKGQVFVL		STHPYGCRVI		QRILEHCTAE
QTLPILEELH		QHTEQLVQDQ		YGNYVIQHVL		EHGRPEDKSK		IVSEIRGKVL
ALSQHKFASN		VVEKCVTHAS		RAERALLIDE		VCCQNDGPHS		ALYTMMKDQY
ANYVVQKMID		MAEPAQRKII		MHKIRPHITT		LRKYTYGKHI		LAKLEKYYLK
NSPDLGPIGG		PPNGML

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Spassov D.S., Jurecic R. (2002). Cloning and comparative sequence analysis of PUM1 and PUM2 genes, human members of the Pumilio family of RNA-binding proteins. Gene. 299: 195—204. PMID 12459267 DOI:10.1016/S0378-1119(02)01060-0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Miles W.O., Tschop K., Herr A., Ji J.Y., Dyson N.J. (2012). Pumilio facilitates miRNA regulation of the E2F3 oncogene. Genes Dev. 26: 356—368. PMID 22345517 DOI:10.1101/gad.182568.111
• Lu G., Hall T.M. (2011). Alternate modes of cognate RNA recognition by human PUMILIO proteins. Structure. 19: 361—367. PMID 21397187 DOI:10.1016/j.str.2010.12.019

Див. також

• Хромосома 2