RAB1A

RAB1A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2FOL, 2WWX, 3L0I, 3SFV, 3TKL, 4FMB, 4FMC, 4FMD, 4FME, 4IRU, 4JVS
Ідентифікатори
Символи	RAB1A, RAB1, YPT1, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 179508 MGI: 97842 HomoloGene: 36154 GeneCards: RAB1A
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Меланосома • Golgi membrane • early endosome • ендоплазматичний ретикулум • екзосома • transport vesicle membrane Біологічний процес • COPII-coated vesicle cargo loading • ендоцитоз • establishment of endothelial intestinal barrier • Golgi organization • vesicle transport along microtubule • autophagosome assembly • positive regulation of glycoprotein metabolic process • Автофагія • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • COPII vesicle coating • melanosome transport • growth hormone secretion • defense response to bacterium • protein transport • substrate adhesion-dependent cell spreading • cell migration • vesicle-mediated transport • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • cilium assembly • GO:0090623, GO:1903835, GO:0007092, GO:0051488, GO:0051487 positive regulation of ubiquitin protein ligase activity • посттрансляційна модифікація • GO:0015915 транспорт • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5861	19324
Ensembl	ENSG00000138069	ENSMUSG00000020149
UniProt	P62820	P62821
RefSeq (мРНК)	NM_004161 NM_015543	NM_008996
RefSeq (білок)	NP_004152 NP_056358	NP_033022
Локус (UCSC)	Хр. 2: 65.07 – 65.13 Mb	Хр. 11: 20.15 – 20.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAB1A (англ. RAB1A, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 205 амінокислот, а молекулярна маса — 22 678.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSMNPEYDY		LFKLLLIGDS		GVGKSCLLLR		FADDTYTESY		ISTIGVDFKI
RTIELDGKTI		KLQIWDTAGQ		ERFRTITSSY		YRGAHGIIVV		YDVTDQESFN
NVKQWLQEID		RYASENVNKL		LVGNKCDLTT		KKVVDYTTAK		EFADSLGIPF
LETSAKNATN		VEQSFMTMAA		EIKKRMGPGA		TAGGAEKSNV		KIQSTPVKQS
GGGCC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, автофагія, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Farnsworth C.C., Seabra M.C., Ericsson L.H., Gelb M.H., Glomset J.A. (1994). Rab geranylgeranyl transferase catalyzes the geranylgeranylation of adjacent cysteines in the small GTPases Rab1A, Rab3A, and Rab5A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 11963—11967. PMID 7991565 DOI:10.1073/pnas.91.25.11963
• Stenmark H. (2009). Rab GTPases as coordinators of vesicle traffic. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 10: 513—525. PMID 19603039 DOI:10.1038/nrm2728
• Zhuang X., Adipietro K.A., Datta S., Northup J.K., Ray K. (2010). Rab1 small GTP-binding protein regulates cell surface trafficking of the human calcium-sensing receptor. Endocrinology. 151: 5114—5123. PMID 20861236 DOI:10.1210/en.2010-0422
• Tan Y., Arnold R.J., Luo Z.Q. (2011). Legionella pneumophila regulates the small GTPase Rab1 activity by reversible phosphorylcholination. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 21212—21217. PMID 22158903 DOI:10.1073/pnas.1114023109
• Kirsten M.L., Baron R.A., Seabra M.C., Ces O. (2013). Rab1a and Rab5a preferentially bind to binary lipid compositions with higher stored curvature elastic energy. Mol. Membr. Biol. 30: 303—314. PMID 23815289 DOI:10.3109/09687688.2013.818725

Див. також

• Хромосома 2