RAB6B

RAB6B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2E9S, 2FE4, 2FFQ
Ідентифікатори
Символи	RAB6B, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 615852 MGI: 107283 HomoloGene: 39749 GeneCards: RAB6B
Пов'язані генетичні захворювання
	натуральна віспа
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • GTP binding; • myosin V binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0006184 GTPase activity;
Клітинна компонента	• Golgi membrane; • мембрана; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment; • гіалоплазма; • комплекс Ґольджі; • presynapse; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum; • protein transport; • intra-Golgi vesicle-mediated transport; • retrograde transport, endosome to Golgi; • vesicle-mediated transport; • intracellular protein transport; • Rab protein signal transduction; • small GTPase mediated signal transduction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	51560
	270192
	ENSG00000154917
	ENSMUSG00000032549
	Q9NRW1
	P61294
	NM_016577; NM_001363953
	NM_173781
	NP_057661; NP_001350882
	NP_776142
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RAB6B (англ. RAB6B, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 208 амінокислот, а молекулярна маса — 23 462^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAGGDFGNP	LRKFKLVFLG	EQSVGKTSLI	TRFMYDSFDN	TYQATIGIDF
LSKTMYLEDR	TVRLQLWDTA	GQERFRSLIP	SYIRDSTVAV	VVYDITNLNS
FQQTSKWIDD	VRTERGSDVI	IMLVGNKTDL	ADKRQITIEE	GEQRAKELSV
MFIETSAKTG	YNVKQLFRRV	ASALPGMENV	QEKSKEGMID	IKLDKPQEPP
ASEGGCSC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chen D., Guo J., Gahl W.A. (1997). RAB GTPases expressed in human melanoma cells. Biochim. Biophys. Acta. 1355: 1—6. PMID 9030196 DOI:10.1016/S0167-4889(96)00169-3
Garcia-Saez I., Tcherniuk S., Kozielski F. (2006). The structure of human neuronal Rab6B in the active and inactive form. Acta Crystallogr. D. 62: 725—733. PMID 16790928 DOI:10.1107/S0907444906015319