RAB7B

RAB7B
Ідентифікатори
Символи	RAB7B, RAB7, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	MGI: 2442295 HomoloGene: 64833 GeneCards: RAB7B
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • ендосома • late endosome • комплекс Ґольджі • trans-Golgi network • лізосома • phagocytic vesicle membrane • phagocytic vesicle • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • late endosome membrane • vacuolar membrane Біологічний процес • protein transport • negative regulation of toll-like receptor 9 signaling pathway • late endosome to Golgi transport • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of megakaryocyte differentiation • negative regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway • positive regulation of interleukin-6 production • cellular response to interferon-gamma • intracellular protein transport • endosome to lysosome transport • Rab protein signal transduction • phagosome-lysosome fusion Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	338382	226421
Ensembl	ENSG00000276600	ENSMUSG00000052688
UniProt	Q96AH8	Q8VEA8
RefSeq (мРНК)	NM_001164522 NM_001304839 NM_177403	NM_145509 NM_001311096
RefSeq (білок)	NP_001157994 NP_001291768 NP_796377	NP_001298025 NP_663484
Локус (UCSC)	Хр. 1: 205.98 – 206 Mb	Хр. 1: 131.62 – 131.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAB7B (англ. RAB7B, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 199 амінокислот, а молекулярна маса — 22 511.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNPRKKVDLK		LIIVGAIGVG		KTSLLHQYVH		KTFYEEYQTT		LGASILSKII
ILGDTTLKLQ		IWDTGGQERF		RSMVSTFYKG		SDGCILAFDV		TDLESFEALD
IWRGDVLAKI		VPMEQSYPMV		LLGNKIDLAD		RKVPQEVAQG		WCREKDIPYF
EVSAKNDINV		VQAFEMLASR		ALSRYQSILE		NHLTESIKLS		PDQSRSRCC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bucci C., Bakke O., Progida C. (2010). Rab7b and receptors trafficking. Commun. Integr. Biol. 3: 401—404. PMID 21057625 DOI:10.4161/cib.3.5.12341
• Seto S., Tsujimura K., Koide Y. (2011). Rab GTPases regulating phagosome maturation are differentially recruited to mycobacterial phagosomes. Traffic. 12: 407—420. PMID 21255211 DOI:10.1111/j.1600-0854.2011.01165.x

Див. також

• Хромосома 1