RABGGTB

RABGGTB
Ідентифікатори
Символи	RABGGTB, GGTB, Rab geranylgeranyltransferase beta subunit, Rab geranylgeranyltransferase subunit beta
Зовнішні ІД	OMIM: 179080 MGI: 99537 HomoloGene: 3371 GeneCards: RABGGTB
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • Rab geranylgeranyltransferase activity • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • зв'язування з іоном металу • prenyltransferase activity Клітинна компонента • Rab-protein geranylgeranyltransferase complex • клітинна мембрана • гіалоплазма Біологічний процес • protein geranylgeranylation • зір • regulation of apoptotic process • посттрансляційна модифікація • protein prenylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5876	19352
Ensembl	ENSG00000137955	ENSMUSG00000038975
UniProt	P53611	P53612
RefSeq (мРНК)	NM_004582	NM_001163478 NM_001163479 NM_011231
RefSeq (білок)	NP_004573	NP_001156950 NP_001156951 NP_035361
Локус (UCSC)	Хр. 1: 75.79 – 75.8 Mb	Хр. 3: 153.61 – 153.62 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RABGGTB (англ. Rab geranylgeranyltransferase beta subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 331 амінокислот, а молекулярна маса — 36 924.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGTPQKDVII		KSDAPDTLLL		EKHADYIASY		GSKKDDYEYC		MSEYLRMSGI
YWGLTVMDLM		GQLHRMNREE		ILAFIKSCQH		ECGGISASIG		HDPHLLYTLS
AVQILTLYDS		INVIDVNKVV		EYVKGLQKED		GSFAGDIWGE		IDTRFSFCAV
ATLALLGKLD		AINVEKAIEF		VLSCMNFDGG		FGCRPGSESH		AGQIYCCTGF
LAITSQLHQV		NSDLLGWWLC		ERQLPSGGLN		GRPEKLPDVC		YSWWVLASLK
IIGRLHWIDR		EKLRNFILAC		QDEETGGFAD		RPGDMVDPFH		TLFGIAGLSL
LGEEQIKPVN		PVFCMPEEVL		QRVNVQPELV		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• Johannes L., Perez F., Laran-Chich M.P., Henry J.P., Darchen F. (1996). Characterization of the interaction of the monomeric GTP-binding protein Rab3a with geranylgeranyl transferase II. Eur. J. Biochem. 239: 362—368. PMID 8706741 DOI:10.1111/j.1432-1033.1996.0362u.x
• van Bokhoven H., Rawson R.B., Merkx G.F.M., Cremers F.P.M., Seabra M.C. (1996). cDNA cloning and chromosomal localization of the genes encoding the alpha- and beta-subunits of human Rab geranylgeranyl transferase: the 3' end of the alpha-subunit gene overlaps with the transglutaminase 1 gene promoter. Genomics. 38: 133—140. PMID 8954794 DOI:10.1006/geno.1996.0608
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Si X., Zeng Q., Ng C.H., Hong W., Pallen C.J. (2001). Interaction of farnesylated PRL-2, a protein-tyrosine phosphatase, with the beta-subunit of geranylgeranyltransferase II. J. Biol. Chem. 276: 32875—32882. PMID 11447212 DOI:10.1074/jbc.M010400200
• Farnsworth C.C., Seabra M.C., Ericsson L.H., Gelb M.H., Glomset J.A. (1994). Rab geranylgeranyl transferase catalyzes the geranylgeranylation of adjacent cysteines in the small GTPases Rab1A, Rab3A, and Rab5A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 11963—11967. PMID 7991565 DOI:10.1073/pnas.91.25.11963
• Baron R.A., Seabra M.C. (2008). Rab geranylgeranylation occurs preferentially via the pre-formed REP-RGGT complex and is regulated by geranylgeranyl pyrophosphate. Biochem. J. 415: 67—75. PMID 18532927 DOI:10.1042/BJ20080662

Див. також

• Хромосома 1